抄録/ポイント:
抄録/ポイント
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無標識ショットガンプロテオミクス作業フローにおける蛋白質同一性の検証の未解決問題によって動機づけられて,著者らは,実例/ペプチドを通して利用可能な測定を用いてクラス/蛋白質ラベルを確証するための試験手順を提示する。より一般的に,同じクラスに割り当てられたインスタンスの部分集合に対する異常値として,いくつかの距離(または準距離)測度に基づいて,考えられるインスタンスを同定する問題に対する解決策を示した。提案した手順はノンパラメトリックであり,測定距離に関する特定の分布仮定を必要としない。試験手順の根底にある唯一の仮定は,同じクラス内のインスタンス間の測定距離が,異なるクラスからのインスタンス間の測定距離よりも確率的に小さいことである。テストは,タイプIとタイプII誤差確率を同時に制御し,一方,初期クラスラベリングの検証手順で誘発された反復試験の全体的誤差確率を制御することを示した。理論的結果は,プロテオミクス作業フロー応用における標識検証のための典型的なセットアップをシミュレートする広範な数値研究の結果で補足される。これらの結果は,著者らの方法の適用性と実行可能性を示す。誤標識の25%までも,著者らの試験手順は,高い特異性を維持し,誤標識インスタンスの割合を大幅に削減する。【JST・京大機械翻訳】