機能的部位での構造的差異を持つミツバチビテロゲニン蛋白質配列の121変異体の同定【JST・京大機械翻訳】

Leipart, V.; Ludvigsen, J.; Kent, M.; Sandve, S.; To, T.-H.; Arnyasi, M.; Kreibich, C. D.; Dahle, B.; Amdam, G. V.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202202517566388 整理番号：22P0313739

機能的部位での構造的差異を持つミツバチビテロゲニン蛋白質配列の121変異体の同定【JST・京大機械翻訳】

Identification of 121 variants of honey bee Vitellogenin protein sequences with structural differences at functional sites

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発行年： 2022年01月28日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年01月28日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

蛋白質は,中心機能を維持し,絶えず変化する環境で生じるニーズを収容する選択下にある。機能を保存する正の選択と中性ドリフトは蛋白質変異体の多様性をもたらす。多様性の量は蛋白質間で異なる:多機能性または疾患関連蛋白質は免疫の幾つかの側面に関与する蛋白質よりも少ない変異体を持つ傾向がある。本研究は,ミツバチ(Apis mellifera)が多機能性で高度に発現し,免疫において役割を果たす,広く研究された蛋白質ビテロゲニン(Vg)に焦点を当てる。しかし,この蛋白質のコード配列における自然変化,またはアミノ酸-高度化変異体が構造-機能関係にどのような影響を与えるかについてはほとんど知られていない。ここでは,15か国からの生体試料を用いてミツバチVgの対立遺伝子変異をマッピングした。543ハチの成功したバーコードアンプリコンナノポア配列決定は121の蛋白質変異体を明らかにし,Vgにおける高レベルの多様性を示した。非同義一塩基多型(nsSNPs)の分布は異なる機能を持つ蛋白質領域間で異なることを見出した。DNAおよび蛋白質-蛋白質相互作用に関与するドメインは,蛋白質脂質結合空洞よりnsSNPsが少なかった。蛋白質の中心機能が異なる変異体でどのように維持されるか,また変異パターンが病原体と栄養からの選択についてどのように情報を与えるかを概説した。【JST・京大機械翻訳】

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, , , , , 【Automatic Indexing@JST】

分子構造 , 進化論一般 , 分子遺伝学一般 , 酵素一般

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