癌におけるイントロンレス遺伝子の組織特異的調節的役割の解読【JST・京大機械翻訳】

Avina-Padilla, K.; Ramirez-Rafael, J. A.; Herrera-Oropeza, G. E.; Romero, G.; Zambada-Moreno, O.; Gupta, I.; Hernandez-Rosales, M.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202202547564231 整理番号：22P0315992

癌におけるイントロンレス遺伝子の組織特異的調節的役割の解読【JST・京大機械翻訳】

Deciphering the tissue-specific regulatory role of intronless genes across cancers

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発行年： 2022年02月22日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年02月22日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

イントロンを欠くイントロン遺伝子(IGs)または単一エクソン遺伝子は,ほとんどの真核生物で見出される。特に,IGsは選択的スプライシングにより調節されないことから,より高い転写忠実度を示し,治療に対する標的としてより良い予測可能なバイオマーカーと容易な調節を示唆した。癌は,複数の機能不全生物学的過程と関連する進行性非制御細胞分裂に依存する複雑な疾患である。腫瘍不均一性は,癌診断および治療において最も挑戦的な特徴のままである。IGsの臨床的関連性を考えると,著者らは,それらのユニークな発現プロファイルとインタラクトームを同定し,8つの異なる癌にわたって機能的特徴として作用する可能性がある。ヒトゲノムにおける940の蛋白質コードIGsを同定し,その約35%は分析した癌データセットで差次的に発現した。特に,差次的に発現したIGの[ ̄]78%は,腫瘍細胞において高い発現で転写リプログラミングを受けた。注目すべきことに,調べたすべての腫瘍において,ヌクレオソームとクロマチン凝縮過程に富む染色体6の領域に位置するデアセチラーゼ-ヒストンのグループの高度に保存された誘導がなされた。本研究は,癌タイプを通しての差次的に発現したヒトイントロンレス遺伝子が,ESCA,GBMおよびLUAD腫瘍に対する特異的PPIネットワークに関与するエピジェネティック調節役割において一般的であることを強調した。著者らは,IGsが転写および転写後レベルで腫瘍表現型において重要な役割を担っていることを決定し,相互作用ミクス再配線のような重要な機構を有する。【JST・京大機械翻訳】

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遺伝子発現

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