ペアワイズと高次のエピスタティック相互作用は喘息のアフリカ系アメリカ人青年における気管支拡張薬応答に有意な影響を及ぼす【JST・京大機械翻訳】

Magana, J.; Contreras, M.; Keys, K.; Risse-Adams, O.; Goddard, P. C.; Zeiger, A. M.; Mak, A. C. Y.; Elhawary, J. R.; Samedy-Bates, L.-A.; Lee, E.; Thakur, N.; Hu, D.; Eng, C.; Salazar, S.; Huntsman, S.; Hu, T.; Burchard, E. G.; White, M. J.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202202561403526 整理番号：22P0227656

ペアワイズと高次のエピスタティック相互作用は喘息のアフリカ系アメリカ人青年における気管支拡張薬応答に有意な影響を及ぼす【JST・京大機械翻訳】

Pairwise and Higher-Order Epistatic Interactions Have a Significant Impact on Bronchodilator Drug Response in African American Youth with Asthma

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資料名：
発行年： 2020年03月05日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2020年03月05日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

【背景】喘息は,米国の小児の間で主要な慢性疾患の1つである。喘息有病率はアフリカ系アメリカ人(11.2%)でヨーロッパアメリカ人(7.7%)より高かった。気管支拡張薬は,急性喘息症状に対する第一選択療法の一部と救出薬である。気管支拡張薬反応(BDR)は,異なる人種/民族群の間で実質的に変化する。アフリカ系アメリカ人における喘息有病率は,ヨーロッパアメリカ人よりもわずか3.5%高いが,アフリカ系アメリカ人における喘息死亡率は,ヨーロッパアメリカ人の4倍である。BDRの変化は,この健康格差を説明する際に重要な役割を果たす可能性がある。BDRのような複雑な表現型における異なる健康結果の理解を改善するために,環境および生物学的変数間の相互作用を考えることが重要である。【結果】著者らは,統計エピスタシスネットワーク(ViSEN)の可視化を用いて,喘息の617人のアフリカ系アメリカ人青年におけるBDRに及ぼす環境,社会的,および生物学的変数の間のペアワイズおよび3変数相互作用の影響を評価した。ViSENは,相互作用効果を同定できるノンパラメトリックエントロピーベースアプローチである。完全なデータセットおよび性層化サブセットにおける解析を行った。完全なデータセットにおける分析は,BDRと関連した6つの有意な相互作用を同定し,その最強は出生前煙曝露,年齢,および全体的アフリカ祖先(IG:1.09%,p=0.005)の間の相互作用であった。性別-層別分析は,雌と雄に対する付加的有意ではあるが分岐的結果をもたらし,性特異的影響の存在を示した。結論:本研究は,喘息のアフリカ系アメリカ人小児におけるBDRに有意に影響する新規相互作用効果を同定した。特に,高次相互作用の影響は,BDRに対するペアワイズまたは主効果より大きく,この表現型に影響する遺伝的および環境的因子のネットワークの複雑性を強調することを見出した。ViSENによって明らかにされたいくつかの関連は,BDRのような複雑な表現型を研究するとき,線形および非線形相互作用効果の両方を検出するために最適化した統計的方法を採用することの重要性を強調する回帰ベースの方法を用いて検出されなかった。本研究で得られた情報は,BDRに影響する環境および健康関連因子間の相互作用の複雑な性質の理解および理解を深め,将来の研究を設計する生物医学研究者にとって貴重である。【JST・京大機械翻訳】

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呼吸器の臨床医学一般 , 免疫反応一般 , 呼吸器疾患の薬物療法

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