界面活性剤感受性膜蛋白質集合の同定,安定化,精製のためのペプチドディスクとプロテオミクスを組み合わせた方法の開発【JST・京大機械翻訳】

Young, J. W.; Wason, I. S.; Zhao, Z.; Kim, S.; Aoki, H.; Phanse, S.; Rattray, D. G.; Foster, L. J.; Babu, M.; Duong, F.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202202588524791 整理番号：22P0317074

界面活性剤感受性膜蛋白質集合の同定,安定化,精製のためのペプチドディスクとプロテオミクスを組み合わせた方法の開発【JST・京大機械翻訳】

Development of a Method Combining Peptidiscs and Proteomics to Identify, Stabilize and Purify a Detergent-Sensitive Membrane Protein Assembly

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発行年： 2022年03月03日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年03月03日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

ペプチディスク膜模倣は,細菌膜プロテオームの水溶性界面活性剤フリー粒子への全体的再構成を可能にし,ペプチディスクライブラリーと呼ばれる。ここでは,天然の発現レベルに存在する脆弱な膜蛋白質複合体を安定化するため,親和性精製および質量分析(AP/MS)とペプチディスクライブラリーおよび染色体レベル遺伝子標識技術を組み合わせた方法を提示する。この方法は,蛋白質分離中の界面活性剤への長い曝露による,ベイト蛋白質過剰生産と蛋白質複合体解離に起因する共通アーチファクトを回避する。事例研究としてE.coli Secシステムを用い,9種類の異なる内在性膜サブユニットから成るHMD複合体と名付けたトランスロコンの拡張版を同定した。この複合体はペプチディスクで安定であるが,界面活性剤で解離する。この天然レベルのプロテオーム情報により,最小蛋白質解離でHMD複合体の精製を可能にする手順を設計し,検証した。これらの結果は,脆弱な膜蛋白質集合体の発見および安定化のためのペプチディスクおよびAP/MSの有用性を強調する。【JST・京大機械翻訳】

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蛋白質・ペプチド一般

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