dbDEMC3.0:ヒトおよびモデル生物の癌における差次的発現miRNAの機能的探索【JST・京大機械翻訳】

Xu, F.; Wang, Y.; Lin, Y.; Zhou, C.; Wang, H.; Teschendorff, A. E.; Zhao, Y.; Zhao, H.; He, Y.; Zhang, G.; Yang, Z.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202202689092094 整理番号：22P0314965

dbDEMC3.0:ヒトおよびモデル生物の癌における差次的発現miRNAの機能的探索【JST・京大機械翻訳】

dbDEMC 3.0: Functional Exploration of Differentially Expressed miRNAs in Cancers of Human and Model Organisms

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発行年： 2022年02月10日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年02月10日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

マイクロRNA(miRNA)は遺伝子発現において重要な調節因子である。miRNA発現の脱調節は,細胞の生理的状態から病理学的状態への変換で広く報告されている。マイクロアレイおよびmiRNA-seqのようなハイスループット技術を用いて,種々のヒト癌において,大量の差次的発現miRNA(DEM)が同定されている。ハイスループット実験情報による公表研究のマイニングを通して,ヒト癌(dbDEMC)における差別的に発現されたmiRNAのデータベースを,DEMsの貯蔵とクエリのための系統的資源を提供する目的で構築し,ここでは,マウスとラットからのデータを含む,以前のバージョンより2倍多いデータエントリを含むバージョン3.0へのdbDEMCの更新を報告する。dbDEMC3.0は40の異なる癌タイプで3,268のユニークなDEMsを含む。差分発現解析のための現在のデータセットは,9つの一般化カテゴリーに拡大した。さらに,現在の放出は,実験的に検証されたターゲットから得られたDEMsの機能的アノテーションを統合する。アノテーションは,DEMsの統合分析に大いに有益である。要約すると,dbDEMC3.0は,ヒト癌におけるDEMsの分子機能および調節機構を特性化するための貴重な資源を提供する。dbDEMC3.0はhttps://www.biosino.org/dbDEMCで自由にアクセスできる。【JST・京大機械翻訳】

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, , , , , , , , , 【Automatic Indexing@JST】

遺伝子発現

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