水素-重水素交換質量分析は基質と輸送体への阻害剤結合に異なる動力学を捕捉する【JST・京大機械翻訳】

Jia, R.; Martens, C.; Shekhar, M.; Pant, S.; Pellowe, G. A.; Lau, A. M.; Findlay, H. E.; Harris, N. J.; Tajkhorshid, E.; Booth, P. J.; Politis, A.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202202694205247 整理番号：22P0230515

水素-重水素交換質量分析は基質と輸送体への阻害剤結合に異なる動力学を捕捉する【JST・京大機械翻訳】

Hydrogen-deuterium exchange mass spectrometry captures distinct dynamics upon substrate and inhibitor binding to a transporter

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発行年： 2020年04月04日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2020年04月04日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

※このプレプリント論文は学術誌に掲載済みです。なお、学術誌掲載の際には一部内容が変更されている可能性があります。

プロトン共役輸送体は膜貫通プロトン勾配を用いて,細胞内の栄養素の活発な輸送を出力する。高分解能構造は,プロトンとリガンド結合の間のカップリングと輸送に伴う配座転移を捉えることに失敗することが多い。HDX-MSと変異誘発及びMDシミュレーションを組み合わせて,原型輸送体XylEの分子機構を解離した。保存されたアスパラギン酸のプロトン化は,外向きから内向きへの立体配座転移を誘発することを示した。この転移は基質キシロースの存在下でのみ生じ,一方,阻害剤グルコースは外向きの状態で輸送体をロックした。MDシミュレーションは,プロトン化とキシロース結合の組み合わせのみ,およびグルコースではなく,立体配座スイッチの輸送体をセットアップすることを示している。全体として,阻害剤と基質結合の立体配座動力学を区別するHDX-MSのユニークな能力を示し,基質結合とプロトン化の間の特異的なアロステリックカップリングが輸送を開始する重要な段階であることを示した。【JST・京大機械翻訳】

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細胞膜の輸送 , 分子構造

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