細菌オペロンにおけるmRNA安定性を制御する配列と構造決定因子の系統的定量化【JST・京大機械翻訳】

Cetnar, D. P.; Salis, H. M.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202202729376082 整理番号：22P0242697

細菌オペロンにおけるmRNA安定性を制御する配列と構造決定因子の系統的定量化【JST・京大機械翻訳】

Systematic Quantification of Sequence and Structural Determinants Controlling mRNA stability in Bacterial Operons

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発行年： 2020年07月22日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2020年07月22日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

※このプレプリント論文は学術誌に掲載済みです。なお、学術誌掲載の際には一部内容が変更されている可能性があります。

mRNA分解は全ての遺伝子発現レベルに影響する中心的過程であり,mRNA減衰速度を制御する決定因子は特性化されていない。ここでは,細菌オペロンにおけるmRNA安定性を制御する配列および構造決定因子を解明するために,合成生物学,学習-設計アプローチを適用した。5UTR,遺伝子間および3UTR領域におけるRNAe結合部位特性,翻訳開始速度,および転写ターミネーター効率を系統的に変化させ,RT-qPCRアッセイを用いてそれらのmRNAレベルを測定する,82オペロンをデザインし,構築し,特性化した。長い一本鎖RNAを5UTRに導入すると,mRNAレベルが9.4倍まで減少し,翻訳速度の低下がmRNAレベルを11.8倍まで低下させることを示した。また,遺伝子間領域のRNAe結合部位はmRNAレベルに対してはるかに低い効果を持つことを見出した。驚くべきことに,転写停止効率の変化または3UTRへの長い一本鎖RNAの導入は上流mRNAレベルに影響しなかった。これらの測定から,優れた定量的対応でリボソーム保護とRNAe活性の生物物理学的モデルを開発,検証した。また,mRNA安定性を合理的に制御するための設計規則を定式化し,望ましい機能性を持つ遺伝子操作システムの自動設計を容易にした。【JST・京大機械翻訳】

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, 【Automatic Indexing@JST】

遺伝子発現

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