チャク(Tectona grandis L.f)に特に関連したLamiaceaeメンバー間の被子植物と系統発生関係の葉緑体ゲノム分析【JST・京大機械翻訳】

Maheswari, P.; Kunhikannan, C.; Yasodha, R.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202202783049488 整理番号：22P0233880

チャク(Tectona grandis L.f)に特に関連したLamiaceaeメンバー間の被子植物と系統発生関係の葉緑体ゲノム分析【JST・京大機械翻訳】

Chloroplast genome analysis of Angiosperms and phylogenetic relationships among Lamiaceae members with particular reference to teak (Tectona grandis L.f)

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発行年： 2020年05月05日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2020年05月05日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

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多くの経済的に重要な作物と樹木を含む開花植物に対する包括的系統樹のアベイラビリティは,多様な応用のための植物生物学者の必須要件の1つである。植物種間の進化的関係を同定するために,3265のアンギオ精子分類群の葉緑体ゲノムの使用に関する最初の研究である。葉緑体ゲノムからの60の遺伝子を連結し,系統樹を生成するために利用した。全体として,系統発生は,あいまいな分類学または不正確な同定のため,非常に少ない分類群を占める非常に少ない分類群を有する,アンギオ精子Phylogenyグループ(APG)IV分類と対応していた。単純配列反復(SSRs)をほとんどすべての分類群から同定し,種々の遺伝子解析におけるそれらの使用の可能性を示唆した。A/Tモノヌクレオチドの大きな割合(95.6%)を記録し,一方,ジ,トリ,テトラ,ペンタおよびヘキサヌクレオチドは5%未満に蓄積した。Tectona grandis L.fの分類学的状態のあいまいさを,ヌクレオチド多様性を通して近縁Lamiaceaeメンバーと葉緑体ゲノムを比較することによって評価し,逆反復領域の拡大を収縮させた。遺伝子含有量は高度に保存されていたが,ゲノムの構造変化は明らかであった。系統発生分析は,Tectonaが亜科Tectonoideaeに適格であると示唆した。遺伝子間および遺伝子配列におけるヌクレオチド多様性は,DNAバーコーディング応用において高いポテンシャルを持つ,pH-atpI,psc4-psbJ,ndhF,rpl32およびycf1のような,rps16-trnQのような顕著な超可変領域を明らかにした。【JST・京大機械翻訳】

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植物分類学 , 進化論一般

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