プレプリント
J-GLOBAL ID:202202202837968239   整理番号:22P0182426

複雑なコアセルベーションの第2段階としての液-液相分離【JST・京大機械翻訳】

Liquid-liquid Phase Separation as the Second Step of Complex Coacervation
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資料名:
発行年: 2020年08月17日  プレプリントサーバーでの情報更新日: 2020年08月17日
JST資料番号: O7000B  資料種別: プレプリント
記事区分: プレプリント  発行国: アメリカ合衆国 (USA)  言語: 英語 (EN)
抄録/ポイント:
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チロシンとアルギニン残基の間のπ-カチオン結合によって媒介される液体液相分離(LLPS)は生物学的に重要である。複雑なコアセルベーションとの密接な類似性における凝縮相における蛋白質間の相互作用を理解するために,チロシン(pY)とアルギニン(pR)を含むオリゴマ間の多重umbrella計算を行った。pR-pY錯化がエネルギー的に駆動されることを見出した。メタダイナミクスシミュレーションは,錯体生成のこのエネルギーが主にπ-カチオン結合に由来することを明らかにした。複雑なコアセルベーションの2番目の結合段階に対するランニング自由エネルギー計算において,この過程とπ媒介LLPSの間の顕著な類似性を見出した。これらの計算は,共通の概念とは反対に,複雑なコアセルベーションが,全体として,エントロピー錯化とそれに続くエネルギー凝集を含む,がアルギニンとチロシン残基を含む蛋白質によって誘発されないと信じる。むしろ,中性ポリイオン対凝集体が一緒に凝集する後者の段階は,πカチオン媒介LLPSの正しい機構である。【JST・京大機械翻訳】
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, 【Automatic Indexing@JST】
分類 (2件):
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分子間相互作用  ,  分子構造 
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