in vivo DNA結合のドメイン分解能マップは亜鉛フィンガー転写因子における体細胞突然変異の調節結果を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Dogan, B.; Kailasam, S.; Corchado, A. H.; Nikpoor, N.; Najafabadi, H. S.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202202933260220 整理番号：22P0257746

in vivo DNA結合のドメイン分解能マップは亜鉛フィンガー転写因子における体細胞突然変異の調節結果を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

A domain-resolution map of in vivo DNA binding reveals the regulatory consequences of somatic mutations in zinc finger transcription factors

出版者サイト {{ this.onShowPLink() }} 複写サービスで全文入手
高度な検索・分析はJDreamⅢで

この文献はプレプリントです。プレプリントについてはこちらをご確認ください。

著者 (5件)： , , , ,
資料名：
発行年： 2020年06月16日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2020年06月16日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

マルチ亜鉛フィンガー蛋白質はヒト転写因子の最大クラスを構成する。DNA結合特異性は,通常,それらのタンデムCys2His2亜鉛フィンガー(ZF)ドメインのサブセットによりコードされるが,DNAに結合するサブセットは,しばしば知られていない。ここでは,in vivo結合データによるDNA認識の文脈認識機械学習に基づくモデルを結合することにより,209ヒト多ZF蛋白質におけるDNA結合に関与する配列選好とZFサブセットを特性化した。in vivoでのDNA結合は,主にZFsの[ ̄]50%により駆動され,DNA結合ZFsは,種内および種内の強い選択的圧力下にあり,それらの変異は,18の組織にわたる汎癌トランス-eQTL解析により明らかにされたように,数百の遺伝子の発現に影響を及ぼすことを示した。マルチZF蛋白質の変異により影響を受ける遺伝子の中で,SP1により調節されるいくつかの発癌因子を同定し,癌におけるSP1アップレギュレーションがこれらの遺伝子の発現を促進し,一方SP1 ZFsの変異はそれらの抑制を誘導することを示した。まとめると,これらの分析は,DNA結合ZFsの変異が癌におけるトランスクリプトームリモデリングに寄与する明確で広範な調節結果を有することを示唆する。【JST・京大機械翻訳】

, , , , , , , , , ,
, , , , , , , 【Automatic Indexing@JST】

遺伝子発現 , 生物学的機能

, , , , , , ,

前のページに戻る