プレプリント
J-GLOBAL ID:202202203040198191   整理番号:22P0269753

ゲノムデータからの発生特異的SARS-CoV-2疫学的パラメータの推定【JST・京大機械翻訳】

Estimates of outbreak-specific SARS-CoV-2 epidemiological parameters from genomic data
著者 (4件):
資料名:
発行年: 2020年09月14日  プレプリントサーバーでの情報更新日: 2020年09月14日
JST資料番号: O7002B  資料種別: プレプリント
記事区分: プレプリント  発行国: アメリカ合衆国 (USA)  言語: 英語 (EN)
抄録/ポイント:
抄録/ポイント
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ゲノムデータの系統力学的解析のみに基づいて,10か国と1巡航船で分布する15の異なるSARS-CoV-2発生に対する基本的生殖数と症例数を推定した。著者らの結果は,有意な公衆衛生介入の前に,これらの発生の大多数(10)の生殖数は類似であり,中央値事後推定値は1.4~2.8の範囲であることを示した。これらの推定は,従来のラインリストデータに基づくものによって提供されるものと相補的な見解を提供する。ゲノムベースの見解は,試験プロトコル,試験強度,および関心のコミュニティへの事例の輸入における差異から生じるバイアスに対して,かなり感受性が低い。ここで報告した解析では,ゲノムデータは,どのサンプルが特定の流行に属するかに関する情報を主に提供する。一度これらの発生が同定されると,サンプリング日付は生殖数に関する情報の大部分を運ぶ。最後に,各発生に対する累積症例数のゲノムベース推定を提供し,各発生を収容する集団内の未報告感染量について推測する。これらの結果は,研究した集団の大多数(7)に対して,記録された症例の数は推定累積症例数よりはるかに大きく,これらの個体群における非配列病原体多様性の存在を示唆する。2019年後期のCOVID-19発生の始まり,地球周辺の研究者は,パラメータR0によって定量化されたように,公衆衛生介入の前に集団を通して病気が広がる速度を推定することを追求した。これはしばしばケースカウントデータに基づいて推定され,輸入事例の存在によりバイアスされる可能性がある。これを克服するために,世界中の研究室により利用可能なSARS-CoV-2ゲノムにBayes系統動的方法を適用することによりR0を推定した。15の異なる発生に対するR0と絶対感染計数推定値を提供した。これらの推定は,病気のベースライン伝播動力学の理解に寄与し,これは,流行に対する将来の公衆衛生応答を導くのに重要である。【JST・京大機械翻訳】
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分類 (2件):
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感染症・寄生虫症一般  ,  生殖器官 
タイトルに関連する用語 (5件):
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