SARS-CoV-2 Omicron変異体の計算機解析からの洞察: 宿主-病原体相互作用,病原性および治療可能性【JST・京大機械翻訳】

Parvez Md Sorwer Alam; Saha Manash Kumar; Ibrahim Md.; Araf Yusha; Islam Md. Taufiqul; Ohtsuki Gen; Hosen Mohammad Jakir

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202203124963985 整理番号：22P0277336

SARS-CoV-2 Omicron変異体の計算機解析からの洞察: 宿主-病原体相互作用,病原性および治療可能性【JST・京大機械翻訳】

Insights from a computational analysis of the SARS-CoV-2 Omicron variant: Host-pathogen interaction, pathogenicity and possible therapeutics

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発行年： 2022年01月20日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年01月20日
JST資料番号： O7000B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

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以前の2つの波から回復する世界の試みとして,COVID-19ケースの急増のために,Omicronは従来の治療アプローチをさらに脅かす。ミクロンは,スパイク蛋白質の受容体結合ドメイン(RBD)の10以上の変異を含む,懸念の5番目の変異体(VOC)である。しかし,Omicronに関する広範な研究の欠如は,構造比較によってこの変異体を理解するために相関を確立する必要性を提起した。ここでは,より良い患者管理のための既存の薬剤に対する疫学的特性と応答を理解するために,スパイク蛋白質の野生型と変異体RBD型との免疫情報学的アプローチを通して,そのゲノム配列を評価し,相関し,比較した。著者らのコンピュータ解析は,Omicron変異体の感染性と病原性の痕跡への洞察を提供する。加えて,分析は,高度に感染しているB.1.620変異体に類似した南アフリカのOmicron変異体を代表しているが,顕著な蛋白質内の変異は,その病原性を変化させると仮定される。さらに,ドッキング評価は,ヒト受容体,ACE2およびNRP1との結合親和性における有意差を明らかにした。既存の治療を無効にするその特性のため,分子ドッキング法によりOmicronにコードされた標的蛋白質に対する薬物有効性を評価した。試験した薬剤の大部分は有効であることが証明された。ニルマレルビル(Paxlovid),MPro13bおよびロピナビルは,有効性および有効性の増加を示したが,IvermectinはOmicronに対して最良の結果を示した。【JST・京大機械翻訳】

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分子遺伝学一般 , 神経の基礎医学 , 生物学的機能

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