Arunachal Wakroオレンジの衰退におけるカンキツトリステザウイルス病原性遺伝子型の’relict’西部系統の検出【JST・京大機械翻訳】

Datta, S.; Das, B.; Budhauliya, R.; Gopalakrishnan, R.; Muaka, V.; Meghvansi, M. K.; Rahman, S.; Dwivedi, S. K.; Veer, V.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202203242791420 整理番号：22P0245275

Arunachal Wakroオレンジの衰退におけるカンキツトリステザウイルス病原性遺伝子型の’relict’西部系統の検出【JST・京大機械翻訳】

Detection of 'relict' western lineage of citrus tristeza virus virulent genotype in declining Arunachal Wakro orange

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発行年： 2020年08月18日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2020年08月18日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

※このプレプリント論文は学術誌に掲載済みです。なお、学術誌掲載の際には一部内容が変更されている可能性があります。

東ヒマラヤの footは,オレンジを含む品質の柑橘類果実を生産するための最適な農業気候条件を有することが知られている。東部ヒマラヤの柑橘類成長地域の中で,Arnachal Pradeshの遠方東部のWakroは,インドの政府による地理的指標登録に含まれているWakroオレンジまたはArunahalオレンジとして普及している,その優れた品質オレンジで知られている。しかし,ここ数年の間,Arunahalオレンジ果樹園は,急速な減少症に関連したアブラムシの厳しい寄生を経験しており,農民へのカタストロフィーと州経済を引き起こしている。したがって,2015年に,柑橘類の衰退の病原学的要因を調査するために,重度に影響を受けたオレンジ果樹園の集中的な調査を行った。Wakro果樹園から採取した葉とアブラムシ試料から抽出したRNA試料を3-UTR特異的RT-PCRによりCTV検出に供した。その後,ORF1とCPの遺伝的領域を増幅し,クローン配列決定を行った。BLAST探索は,他の毒性遺伝子型VT配列と現在の配列の密接な相同性を示したが,詳細な系統発生解析は,西部系統に属するVT配列との親和性とクラスタ化を示した。この知見は,インドおよび他の近隣諸国における柑橘類成長果樹園から報告されたCTV配列とかなり異なる。さらに,CP遺伝子配列の低い多様性,組換えパターンおよび他のCTV遺伝子型における現在のものと同一の配列セグメントの存在も明らかにされた。まとめると,これらの観察は,現在のCTVシーケンスの原始的および原始的性質を示し,地球のこの部分におけるCTVの提案された起源と良く調和している。ここでは,インドの他の部分におけるCTV分子疫学とは異なるCTV毒性遺伝子型VTの西部系統の発見を報告し,これらの知見の意味を考察した。【JST・京大機械翻訳】

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果樹 , 果実とその加工品

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