PCaDB-前立腺癌集団コホートからのトランスクリプトームのための包括的かつ対話型データベース【JST・京大機械翻訳】

Li, R.; Zhu, J.; Zhong, W.-D.; Jia, Z.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202203278299735 整理番号：21P0259187

PCaDB-前立腺癌集団コホートからのトランスクリプトームのための包括的かつ対話型データベース【JST・京大機械翻訳】

PCaDB - a comprehensive and interactive database for transcriptomes from prostate cancer population cohorts

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発行年： 2022年01月02日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年01月02日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

前立腺癌(PCa)は,臨床管理において大きな挑戦を示す,非常に多様な臨床結果を有する不均一な疾患である。大きなPCaコホートからの大量のトランスクリプトミクスデータが生成され,PCa疾患の分子特性化および診断および予後シグネチャの開発に対する異常な機会を提供している。散乱した公共データセットの包括的な収集と調和の欠如は,貴重な資源の広範な利用を制約する。本研究では,9,068患者サンプルを有する77のトランスクリプトミクスデータセットからの遺伝子発現プロファイルの包括的なインタラクティブ解析と可視化のためのユーザフレンドリーなデータベース,PCaDBを提示した。PCaDBは,正常なヒト前立腺と30の公表されたPCa予後シグネチャに対する単一細胞RNA配列(scRNAseq)データセットも含む。PCaDBに装備された包括的データ資源と先進分析法は,PCaの不均一性を理解し,正確なPCa診断と予後のための機械学習モデルを開発するためのデータマイニングを大いに促進し,臨床意思決定を助ける。PCaDBはhttp://bioinfo.jialab ucr.org/PCaDB/で公的に利用できる。【JST・京大機械翻訳】

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, , , 【Automatic Indexing@JST】

遺伝子発現

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