qPCR法を用いたテロメア長測定の手法比較研究:文献の批判的評価【JST・京大機械翻訳】

Lindrose, A. R.; McLester-Davis, L. W. Y.; Tristano, R. I.; Kataria, L.; Gadalla, S. M.; Eisenberg, D. T. A.; Verhulst, S.; Drury, S.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202203330043876 整理番号：22P0246982

qPCR法を用いたテロメア長測定の手法比較研究:文献の批判的評価【JST・京大機械翻訳】

Method comparison studies of telomere length measurement using qPCR approaches: a critical appraisal of the literature

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発行年： 2020年10月30日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2020年10月30日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

※このプレプリント論文は学術誌に掲載済みです。なお、学術誌掲載の際には一部内容が変更されている可能性があります。

様々な環境曝露と病気のバイオマーカーとしてのテロメア長(TL)の利用は近年増加している。テロメア長を測定するために様々な方法を開発した。PCRに基づく方法は,ハイスループット能力のため,集団ベースの研究に対して広く普及している。いくつかの研究がTL測定方法を評価してきたが,結果は可変であった。2002年1月1日と2020年5月25日の間に発表されたPCRベースの方法を含むTL測定交差法比較研究の文献レビューを行った。包含基準に適合する合計25の論文を見出した。試料およびDNA品質の方法論的報告の質,PCRアッセイ特性,サンプルブラインド化,および最終TLを決定する分析手法について,紙をレビューした。全体として,qPCRに基づくTL測定の2つの異なる報告ガイドラインにより,方法論的報告は低かった。方法(ピアソンrによって評価されるように)の間に報告された相関には広い範囲があり,アッセイの再現性と方法論的比較の評価には,推奨されたクラス内相関係数(ICC)を利用した研究はほとんどない。ほぼすべての研究のサンプルサイズは100以下であり,統計的電力に関する懸念を提起した。全体として,本レビューは,TL測定方法の間の関係に関する現在の文献が,妥当性と科学的厳密さに欠けていることを見出した。これらの知見を踏まえて,著者らは,PCRに基づくTL測定法のための報告ガイドラインと,断面および縦断的研究の統計力に対するアッセイ再現性(ICC)の効果の分析の結果を示した。厳密な方法論的および統計的報告,適切な試料サイズ,およびブラインド化による追加のクロス実験室研究は,TL測定方法の間の関係と同様に,分析再現性および複製可能性を正確に決定するために必須である。【JST・京大機械翻訳】

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分子遺伝学一般 , バイオアッセイ , 核酸一般 , 細胞分裂・増殖

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