単一ヌクレオチド分解能でのヘリカーゼ転位と巻き戻しの配列依存性メカノ化学的共役【JST・京大機械翻訳】

Laszlo, A. H.; Craig, J. M.; Gavrilov, M.; Tippana, R.; Nova, I. C.; Huang, J. R.; Kim, H. C.; Abell, S. J.; deCampos-Stairiker, M.; Mount, J. W.; Bowman, J. L.; Baker, K. S.; Higinbotham, H.; Bobrovnikov, D.; Ha, T.; Gundlach, J. H.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202203409260325 整理番号：22P0314979

単一ヌクレオチド分解能でのヘリカーゼ転位と巻き戻しの配列依存性メカノ化学的共役【JST・京大機械翻訳】

Sequence-dependent mechanochemical coupling of helicase translocation and unwinding at single-nucleotide resolution.

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発行年： 2022年02月11日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年02月11日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

単分子ナノポアピンセット(SPRNT)を用いて,スーパーファミリー1ヘリカーゼPcrAのミリ秒単一ヌクレオチド段階を,いくつかのkb長DNA分子上または非風上を移動させた。PcrA運動のメカノ化学を包括的に探索するために,多様なATPおよびADP条件下で種々の支援および反対の力の下で2百万以上の酵素段階を記録した。SPRNT模倣力および物理的障壁PcrAの力は,ヘリカーゼが結合蛋白質または二本鎖DNAに遭遇するとき,in vivoで経験する。PcrAs速度論がそのような刺激でどのように変化するかを示した。SPRNTは,観察された酵素動力学と基礎となるDNA配列の直接会合を可能にする。著者らのデータは,ヘリカーゼを通して通過する根底にあるDNA配列が転座と巻き戻しの間の動力学に強く影響することを明らかにした。驚くべきことに,巻き戻し動力学は,単に基礎対によって支配されない。代わりに,PcrAウォークが巻き戻しの多くの動力学を決定する一本鎖DNAのシーケンスは,その配列である。【JST・京大機械翻訳】

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酵素一般

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