マイクロバイオーム関連ネットワークのMeta分析は,疾患のあるマイクロバイオームにおけるジストビオーシスのパターンを明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Lam, T. J.; Ye, Y.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202203529352274 整理番号：22P0312813

マイクロバイオーム関連ネットワークのMeta分析は,疾患のあるマイクロバイオームにおけるジストビオーシスのパターンを明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Meta-analysis of Microbiome Association Networks Reveal Patterns of Dysbiosis in Diseased Microbiomes

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発行年： 2022年01月22日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年01月22日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

ヒト腸ミクロビオームは,宿主の健康と生理学の調節に重要な役割を果たす微生物種の多様で動的な集団から成る。個々の微生物種は特定の疾患状態と関連することが分かっているが,増加する証拠は,高次の微生物相互作用が宿主適応度に対して等しいかより大きな寄与を持つかもしれないことを示唆する。微生物群集動態をより良く理解するために,著者らは,健康と病気の腸ミクロビオーム間の微生物会合ネットワークのメタ分析による相互作用を研究するために,複雑なネットワークを利用した。健康な個人と様々な疾患患者に由来する多数のメタゲノムを利用して,スパース組成データを扱うことができるネットワーク推論の最近の進歩と共に,腸内微生物種の共起に基づく微生物会合ネットワークを推論し,ネットワークを資源(GutNetと命名)として公的に利用可能なネットワークを作った。推定ネットワークのメタ分析を通して,著者らは,様々な細菌門の分化や病気ネットワークにおけるプロテオバクテリア相互作用の濃縮などの健康と疾患状態の間の層別化を助けるネットワーク関連特徴を同定することができた。さらに,我々の知見は,微生物関連における分類群の寄与が,それらの豊度に不均衡であり,微生物種の希少分類群が,微生物群集相互作用の動力学形成に不可欠な部分を占めることを示した。全体として,このメタ分析は,健康と疾患表現型の間の微生物群集動力学への貴重な洞察を明らかにした。【JST・京大機械翻訳】

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, , , 【Automatic Indexing@JST】

微生物の生態 , 異種生物間相互作用 , 遺伝子の構造と化学

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