近接標識および定量的プロテオミクスにより明らかにしたエメリンおよびLBRの共有および特徴的な近傍【JST・京大機械翻訳】

Cheng, L.-C.; Zhang, X.; Abhinav, K.; Nguyen, J. A.; Baboo, S.; Martinez-Bartolom&eacute, S.; Branon, T. C.; Ting, A. Y.; Loose, E.; Yates, J. R.; Gerace, L.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202203973111410 整理番号：22P0351770

近接標識および定量的プロテオミクスにより明らかにしたエメリンおよびLBRの共有および特徴的な近傍【JST・京大機械翻訳】

Shared and distinctive neighborhoods of emerin and LBR revealed by proximity labeling and quantitative proteomics

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発行年： 2022年05月11日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年05月11日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

エメリンとLBRは内核膜(INM)に集中している核エンベロープ(NE)の豊富な膜貫通蛋白質である。両蛋白質はクロマチン及び核ラミンと相互作用するが,それらは特徴的な生化学的及び機能的特性を有する。ここでは,培養マウス胚線維芽細胞(MEF)におけるエメリンとLBRの近傍を比較するために,遺伝子操作ビオチンリガーゼTurboID(TbID)と定量的プロテオミクスを用いて近接標識を展開した。著者らの分析は,エメリンおよび/またはLBRと選択的に相互作用する232の高い信頼近接パートナー(HCPP)を明らかにし,その内の49は両方によって共有されている。これらは以前に,エメリンまたはLBR機能にリンクしていない付加的蛋白質の宿主と同様に,以前に特性化されたNE濃縮蛋白質を含んでいた。これらの多くはERのTM蛋白質であり,2つのE3ユビキチンリガーゼを含む。直交アプローチとして近接ライゲーションアッセイを用いて,分析した11/12蛋白質に対する近接標識により記述された相互作用を検証し,この分析のロバスト性を支持した。全体として,この研究はINMの景観の大規模マッピングに使用できる方法を示し,エメリンとLBRへの潜在的機能的接続を有する新しい蛋白質群を明らかにした。【JST・京大機械翻訳】

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, , , , , 【Automatic Indexing@JST】

細胞生理一般 , 生物学的機能 , 細胞構成体一般

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