COVID-19感染と伝播は複雑な配列多様性を含む【JST・京大機械翻訳】

Chan, E. R.; Jones, L. D.; Linger, M.; Kovach, J. D.; Torres-Teran, M. M.; Wertz, A.; Donskey, C. J.; Zimmerman, P. A.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202203981049430 整理番号：22P0334841

COVID-19感染と伝播は複雑な配列多様性を含む【JST・京大機械翻訳】

COVID-19 Infection and Transmission Includes Complex Sequence Diversity

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発行年： 2022年04月19日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年04月19日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

SARS-CoV-2全ゲノム配列決定は,ウイルスゲノムにおける多型の出現と,COVID-19パンデミック中のその継続進化の文書化において重要な役割を担っている。ここでは,複数の変異体サージ(例えば,αとDelta)の間に同定された個々の感染の複雑な配列多様性を特徴付けるために,360人の患者からのデータを提示し,[≧]80%のゲノム被覆と[≧]100Xの読み込み深さを必要とした。著者らの調査を通して,著者らは,すべての感染において,流行中のSARS-CoV-2配列多様性と複数のバイ対立遺伝子配列多型の頻繁な発生を,有意に増加することを観察した。この配列多型は,SARS-CoV-2感染が不均一混合物であることを示した。微生物病原体を報告するための内因性は,研究者が大多数のコンセンサス配列を報告することをガイドする。本研究では,このアプローチが,観察された配列変動の少なくとも79%を過小報告していることを見出した。この配列不均一性がドナーからレシピエントへ効率的に伝達されることを見出したので,著者らの知見は,感染の複雑性をモニタリングし,免疫能と免疫不全患者の両方を含むSARS-CoV-2感染と伝達動態を理解するために,より完全に報告する必要があることを示す。大多数のコンセンサス配列で報告されていない多くのヌクレオチド変化は,Omicron BA.1および/またはBA.2変異体におけるSNPsを定義する系統として現在観察された。これは,以前のSARS-CoV-2感染における少数対立遺伝子が,懸念の新しい変異体の継続的な進化において重要な役割を果たす可能性があることを示唆する。【JST・京大機械翻訳】

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遺伝子の構造と化学

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