進化的に分岐するプロカスパーゼ-3の折畳み景観の比較【JST・京大機械翻訳】

Yao, L.; Clark, C.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202204194801938 整理番号：22P0032421

進化的に分岐するプロカスパーゼ-3の折畳み景観の比較【JST・京大機械翻訳】

Comparing the folding landscapes of evolutionarily divergent procaspase-3

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発行年： 2022年01月12日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年01月12日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

すべてのカスパーゼは共通祖先から進化し,その後2つの一般的クラス,炎症またはアポトーシスカスパーゼに発達した。カスパーゼ-ヘモグロビン折畳みは進化のほぼ10億年を通して保存され,それぞれ,開始剤及びエフェクターカスパーゼと呼ばれるアポトーシスカスパーゼの単量体及び二量体サブファミリーの両方に利用される。折畳み景観の保存を調べるために,ゼブラフィッシュ由来のプロカスパーゼ-3bの折畳みと集合をゼブラフィッシュからヒトエフェクタープロカスパーゼと比較した。プロカスパーゼ-3bの尿素誘導平衡折畳み/非折畳みは最小3状態折畳み経路を示し,そこで天然二量体は部分的に折畳まれた二量体中間体に異性化し,次に非折畳みであった。ヒトプロカスパーゼ-3の折畳み景観で観察される部分的折畳み単量体中間体は,ゼブラフィッシュプロカスパーゼ-3bで良くは形成されない。異なる種からのエフェクターカスパーゼを比較することにより,エフェクタープロカスパーゼ二量体がpH依存性配座転移を受け,折畳み景観における立体配座種が類似の自由エネルギーを示すことを示した。まとめると,データは,カスパーゼ-ヘモグロビン折畳みの景観が保存されるが,それは安定性の変化をもたらす折畳み中間体の種特異的安定化または不安定化のための柔軟性を提供することを示した。酵素的に不活性な種を生じる天然二量体の共通pH依存性配座転移は,細胞中のカスパーゼ活性を調節するための可逆的ではあるが,付加的であるかもしれない。【JST・京大機械翻訳】

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細胞生理一般 , 酵素一般

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