治療中の宿主内結核菌多様性とヘテロ耐性の動力学【JST・京大機械翻訳】

Nimmo, C.; Brien, K.; Millard, J.; Grant, A. D.; Padayatchi, N.; Pym, A. S.; O'Donnell, M.; Goldstein, R. A.; Breuer, J.; Balloux, F.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202204222068966 整理番号：22P0260366

治療中の宿主内結核菌多様性とヘテロ耐性の動力学【JST・京大機械翻訳】

Dynamics of within-host Mycobacterium tuberculosis diversity and heteroresistance during treatment

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発行年： 2020年03月03日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2020年03月03日
JST資料番号： O7002B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

※このプレプリント論文は学術誌に掲載済みです。なお、学術誌掲載の際には一部内容が変更されている可能性があります。

【背景】治療中の患者におけるMycobacterium tuberculosis(Mtb)の宿主内遺伝的多様性は,抗生物質および免疫圧への適応を同定する可能性がある。遺伝的ヘテロ耐性の意義と,より特異的なヘテロ接合耐性関連変異体(RAV)の理解は,迅速分子試験および全ゲノム配列決定(WGS)の使用増加により,臨床的に重要である。【方法】南アフリカのKwaZulu-Natalにおける6つの研究からのデータを分析した。大部分の患者(>75%)は,ベースラインリファンピシン耐性を有した。喀痰は,ベースラインでの培養と,6か月まで2と9の間隔の間で採取した。陽性培養はWGSを受けた。混合感染と再感染は分析から除外した。HIV感染,系統2株による感染,および一変量分析における第2選択薬耐性の欠如で,抗レトロウイルス療法を行わなかったので,発見Baseline Mtb全体的遺伝的多様性(治療開始または処方への主要な変化)は,キャビタリー病と関連していた。ベースラインの遺伝的多様性は6か月の転帰と関連していなかった。遺伝的多様性は,ベースラインから1週まで,2つは以前のレベルに戻る前に増加した。ベースラインの遺伝的ヘテロ耐性は,RAVとフルオロキノロン類(9/62[13%])のベダキリン(6/10[60%])に対して最も一般的であった。利用可能な連続分離株を有するWGS上のヘテロ接合RAVのほとんどの患者は,持続性または固定(17/20,85%)を示した。新しいRAVは治療中に9/286(3%)の患者に現れた。まれな変異体を検出する深い配列決定の検証が必要であるが,1症例だけにおいて緊急耐性に先行する低周波RAVを検出することができた。単一株Mtb感染のこの研究において,宿主内細菌遺伝的多様性は転帰を予測しなかったが,宿主と薬物圧力への適応を明らかにした。低周波RAVからの緊急抵抗の予測は,結果として起こる突然変異から過渡的な分離を行うための更なる研究を必要とする。FundingWellcome Trust,NIH/NIAID。【JST・京大機械翻訳】

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微生物感染の生理と病原性 , 感染症・寄生虫症一般

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