ヒトLincRNA-p21センスとアンチセンスAlu逆反復の生物物理学的特性化【JST・京大機械翻訳】

D'Souza, M.; Mrozowich, T.; Badmalia, M. D.; Geeraert, M.; Frederickson, A.; Henrickson, A.; Demeler, B.; Wolfinger, M. T.; Patel, T. R.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202204359631870 整理番号：22P0029318

ヒトLincRNA-p21センスとアンチセンスAlu逆反復の生物物理学的特性化【JST・京大機械翻訳】

Biophysical Characterisation of Human LincRNA-p21 Sense and Antisense Alu Inverted Repeats

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発行年： 2022年01月20日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年01月20日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

ヒト長遺伝子間非コードRNA-p21(LincRNA-p21)は,アポトーシス促進において重要な役割を果たす調節非コードRNAである。LincRNA-p21はまた,p53抑制複合体との相互作用を介して多くのp53標的遺伝子のダウンレギュレーションに重要である。LincRNA-p21と抑制複合体間の相互作用はRNA三次構造に依存した。以前の研究は,SHAPEを用いてセンスおよびアンチセンスヒトLincRNA-p21 AluSx1 IRの二次元二次構造を決定した。しかし,その三次元構造への洞察はなかった。したがって,in vitroで,LincRNA-p21 AluSx1反転反復(IR)のセンスおよびアンチセンス領域を転写し,分析超遠心,サイズ排除クロマトグラフィー,光散乱および小角X線散乱(SAXS)研究を行った。これらの研究に基づき,センスおよびアンチセンスLincRNA-p21の低解像度,3次元構造を決定した。以前に知られている二次元情報を適用して,それらの感覚とアンチセンス高分解能モデルを計算し,それらがSAXSを用いて決定した低解像度構造と一致することを決定した。したがって,著者らの統合アプローチはLincRNA-p21 Alu IRの構造への洞察を提供する。本研究はまた,長い非コードRNAのための高分解能原子論的モデルを得るために,生物物理学的および計算研究と二次構造情報を組み合わせるための実行可能なパイプラインを提供した。【JST・京大機械翻訳】

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遺伝子発現

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