齧歯類媒介コロナウイルスの広範な遺伝的多様性と宿主範囲【JST・京大機械翻訳】

Wang, W.; Lin, X.-D.; Zhang, H.-L.; Wang, M.-R.; Guan, X.-Q.; Holmes, E. C.; Zhang, Y.-Z.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202204421175186 整理番号：22P0244610

齧歯類媒介コロナウイルスの広範な遺伝的多様性と宿主範囲【JST・京大機械翻訳】

Extensive Genetic Diversity and Host Range of Rodent-borne Coronaviruses

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発行年： 2020年08月14日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2020年08月14日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

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中国におけるコロナウイルス(CoV)の遺伝的多様性,宿主会合および進化をより良く理解するために,浙江省および雲南省からサンプリングされた16の異なる種を含む合計696のげっ歯類を分析した。糞便試料の逆トランスクリプターゼPCRに基づくCoVスクリーニングとRdRp遺伝子の配列分析に基づき,Apodemus agrarius,Apodemus latronum,Bandicota indica,Eothenomys miletus,E.eleusis,RattusとRattus,およびR.tanzumiを含む多様なげっ歯類種におけるCoVを同定した。Apodemus chevrieriは,25の齧歯類CoVを持つ特に豊富な宿主であった。遺伝学的および系統学的分析は,以前に同定されたLucheng Rnラットコロナウイルス(LRNV),中国RattusコロナウイルスHKU24(ChRCoV_HKU24)およびLongquan Rlラットコロナウイルス(LRLV)に密接に関連する一連のげっ歯類により運ばれる3つのグループのCoVの存在を明らかにした。LRNVと密接に関連する1つの新たに同定されたA.chevrieri関連ウイルスは,NS2遺伝子を欠く。このウイルスはAcCoV-JC34と類似の遺伝的組織を持ち,最近雲南省の同じげっ歯類種で発見され,それが新しいウイルスサブタイプを表すことを示唆した。特に,宿主ゲノムに由来すると思われるNS2遺伝子の下流に位置する推定非構造NS2b遺伝子を含むLRNVの付加的変異体を同定した。Lijiang-71のORF1a遺伝子でも組換え事象を同定した。まとめると,これらのデータは,げっ歯類由来のCoVの実質的な遺伝的多様性とゲノム複雑性を明らかにし,これらの主要な野生生物ウイルス貯留層の知識を大きく広げる。【JST・京大機械翻訳】

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ウイルスによる動物の伝染病 , 進化論一般 , ウイルスの形態学,分類学 , ウイルスの生化学 , 遺伝子の構造と化学

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