ナノポア直接cDNA配列決定によるC.elegans転写物の定量分析は非トランススプライシングmRNAにおける末端ヘアピンを明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Bernard, F.; Dargere, D.; Rechavi, O.; Dupuy, D.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202204469214663 整理番号：22P0334583

ナノポア直接cDNA配列決定によるC.elegans転写物の定量分析は非トランススプライシングmRNAにおける末端ヘアピンを明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Quantitative analysis of C. elegans transcripts by Nanopore direct-cDNA sequencing reveals terminal hairpins in non trans-spliced mRNAs

出版者サイト {{ this.onShowPLink() }} 複写サービスで全文入手
高度な検索・分析はJDreamⅢで

この文献はプレプリントです。プレプリントについてはこちらをご確認ください。

著者 (4件)： , , ,
資料名：
発行年： 2022年04月14日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年04月14日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

線虫mRNAプロセシングは,snRNPからの21nt配列が一次転写物の元の5末端を置換するトランススプライシング段階を含む。C.elegans mRNAの70%がトランススプライシングに供されていることが長い間保持された。著者らの最近の研究は,この機構がより普及しているが,主流のトランスクリプトーム配列決定法によって完全に捕捉されないことを示唆した。本研究では,ウオームにおけるトランススプライシングの包括的な分析を行うために,Oxfordナノポア長読取増幅フリーシークエンシング技術を使用した。メッセンジャーの5末端にスプライスされたリーダー(SL)配列の存在がライブラリー調製に影響し,それらの自己相補性により配列決定アーチファクトを生成することを示した。著者らの以前の観察と一致して,ほとんどの遺伝子に対するトランススプライシングの証拠を見出した。しかし,遺伝子のサブセットは,わずかにトランススプライシングされるようである。これらのメッセンジャーは全て,SL構造を模倣する5つの末端ヘアピン構造を生成する能力を共有し,それらの非適合性に対する機構的説明を提供する。まとめると,著者らのデータは,C.elegansにおける今日までのSL使用の包括的な定量分析を提供する。【JST・京大機械翻訳】

, , , , , , , , , , , ,
, , , , 【Automatic Indexing@JST】

遺伝子発現 , 遺伝子の構造と化学

, , , , ,

前のページに戻る