抄録/ポイント：
抄録/ポイント
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de novo遺伝子起源化は,以前に非遺伝子ゲノム配列が進化を通して遺伝子的になるが,多様な分類群にわたる進化的新規性の重要な起源としてますます認識されてきた。多くのde novo遺伝子は蛋白質コードであると提案され,いくつかの場合において蛋白質産物を産生することが実験的に示されている。しかし,de novo蛋白質の系統的研究は,蛋白質産物の実験的観察なしにそれらの転写物の翻訳に関する疑問により妨げられてきた。系統的,ORF-集束質量分析-第1計算アプローチを用いて,モデル生物Drosophila melanogasterにおける翻訳(utORF)の証拠を有するほぼ1000の非注釈オープンリーディングフレームを同定し,その内の371は正準開始コドンを持つ。ショウジョウバエのこれらutORFsの比較ゲノム類似性を定量化し,系統層序年齢を推論するために,さらにシンテニーに基づく蛋白質類似性アプローチを開発した。これらの結果を組織およびライフステージ特異的転写および保存に関する参照データセットと組み合わせて,これらのutORF間の異なる性質を同定した。予想に反して,最速進化utORFは,最も若い進化的ではない。精巣より脳においてより多くのutORFを観察した。同定されたutORFの大部分は,偽陰性類似性検出の可能性を説明するので,de novo起源である可能性がある。最後に,推論されたde novo起源事象後の配列分岐は実質的に残っており,de novo蛋白質が頻繁に変化する可能性を高める。著者らの結果は,de novo蛋白質進化において実質的な非認識多様性があることを示唆する:以前に評価されたより多くの可能性がある。分岐進化軌跡があるかもしれない。そして,de novo蛋白質は,頻繁に得られ,失われる可能性がある。全てにおいて,de novo蛋白質進化の単一特性モデルは存在しないが,de novo蛋白質に対する複雑な起源と進化的軌跡が存在する。【JST・京大機械翻訳】
