Electronイベント表現(EER)データは空間および時間分解能の完全保存による効率的なcryoEMファイルストレージを可能にする【JST・京大機械翻訳】

Guo, H.; Franken, E.; Deng, Y.; Benlekbir, S.; Singla Lezcano, G.; Janssen, B.; Yu, L.; Ripstein, Z. A.; Tan, Y. Z.; Rubinstein, J. L.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202204880304762 整理番号：22P0233150

Electronイベント表現(EER)データは空間および時間分解能の完全保存による効率的なcryoEMファイルストレージを可能にする【JST・京大機械翻訳】

Electron Event Representation (EER) data enables efficient cryoEM file storage with full preservation of spatial and temporal resolution

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発行年： 2020年04月28日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2020年04月28日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

※このプレプリント論文は学術誌に掲載済みです。なお、学術誌掲載の際には一部内容が変更されている可能性があります。

直接検出器装置(DDD)カメラは,それらの高い検出量子効率(DQE)と映画データの出力を有する回転電子低温顕微鏡(cryoEM)を有する。カメラの露光速度(電子/ピクセル/秒)に対するカメラフレームレート(フレーム/秒)の高い比率は電子計数を可能にし,それはさらにDQEを改善し,超解像度情報の記録を可能にする。また,Movie出力は,放射損傷に対する試料移動と補償の計算補正を可能にする。しかし,これらの映画は大量のデータを生産するコストに出ている。最終的なフレームレートを減らし,従ってファイルサイズを記憶と画像処理に適したものにするために,連続カメラフレームのグループを和らげることが一般的である。カメラの時間分解能のこの低減は,画像分析中に有利な情報の損失をもたらすデータ取得中に決定する必要がある。ここでは,Falcon DDDカメラのために,サーモフィッシャー科学によって開発された新しいハードウェアによって可能になる,電子計数DDD映画のための,新しいElectronイベント表現(EER)データフォーマットの実験的解析を提示する。このフォーマットは,空間または時間分解能を犠牲にすることなく,生カメラフレームレートでDDD映画の記録を可能にする。実験データは,この方法が超解像度情報を保持し,管理可能なファイルサイズを維持しながら,カメラの物理的フレーム速度における試料移動の補正を可能にすることを示した。EERフォーマットはDDDカメラの全空間と時間分解能を利用する新しい方法の開発を可能にする。【JST・京大機械翻訳】

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, 【Automatic Indexing@JST】

撮像・録画装置 , 図形・画像処理一般

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