抄録/ポイント：
抄録/ポイント
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力感受性停止ペプチドは,翻訳されたようにリボソームを失速することによって蛋白質生合成を調節する。新生停止ペプチドが失速を壊すために十分な大きさの牽引力を経験するとき,合成を再開することができた。効率的な失速は,ペプチジルトランスフェラーゼ中心(PTC)から数十のオングストロームであるアミノ酸を含む多数のアミノ酸の特異的同一性に依存する。力誘導再開の機構とPTCから遠いこれらの必須アミノ酸の役割は現在知られていない。停止ペプチドSecMの力誘導再開経路に沿った障壁を特性化するために,速度論的解析と組み合わせた120秒にわたる数百の独立した分子動力学軌跡を用いた。PTCから遠い必須アミノ酸は,適用力の形質導入を制御する際に主要な役割を果たすことを見出した。失速破壊経路に沿った連続状態では,適用力はSecMとPTCのC末端に達するまで新生鎖を伝播し,翻訳の再開を可能にする立体配座変化を誘導した。VemP失速破壊経路では多重状態を通しての力伝播の類似した機構が観測されたが,VemPの二次構造は中間状態を通して遷移の順序で不均一性を可能にした。両停止ペプチドからの結果は,適用した力に対する応答を仲介し,PTCの失速状態の維持に関与するアミノ酸を遮蔽することにより,リボソームの接触中心から何十のオングストロームである残基が,どのように何十gstromsであるのかを説明する。意義:Signification StatementAs新生蛋白質はリボソームにより合成され,その環境との相互作用はリボソーム触媒中心に伝達される新生蛋白質に牽引力を創り出すことができる。これらの力は,翻訳の速度と結果にも影響する。停止ペプチドに沿った力伝達の経路を特性化するためにシミュレーションを使用し,新生蛋白質における二次構造とそのリボソーム出口トンネルとの相互作用が力伝播を妨げることを見出した。これは,リボソーム触媒中心から離れて何十のオングストロームである停止ペプチドにおけるアミノ酸が失速に寄与し,より広く,新生蛋白質における構造的特徴が,その環境に対して機能的に応答するリボソーム能力をどのように決定するかを示唆する。【JST・京大機械翻訳】
