プレプリント
J-GLOBAL ID:202202204986662234   整理番号:22P0261333

グアテマラ,CAにおけるクラスタ化結核症例の予後の特徴 分子疫学研究からの洞察,2010-2014【JST・京大機械翻訳】

CHARACTERIZATION OF THE PROPORTION OF CLUSTERED TUBERCULOSIS CASES IN GUATEMALA, CA: INSIGHTS FROM A MOLECULAR EPIDEMIOLOGY STUDY, 2010-2014.
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発行年: 2020年03月26日  プレプリントサーバーでの情報更新日: 2020年03月26日
JST資料番号: O7002B  資料種別: プレプリント
記事区分: プレプリント  発行国: アメリカ合衆国 (USA)  言語: 英語 (EN)
抄録/ポイント:
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【背景】低所得設定からの結核症例のクラスタ化の割合に関する情報はほとんどなく,それは進行中の伝達事象を表現できる。2010年~2014年のGuatemala市,Guatemala市における遺伝子型マッチングに基づくクラスター化結核症例の割合,およびHIV感染被験者におけるこれらのクラスター化症例に関連する潜在的危険因子を初めて調査した。さらに,この国のM.tuberculosis分離株の遺伝的多様性を示した。デザインと方法は,2010~2014年のGuatemala市,Guatemala市の紹介結核研究所に試料を提出するHIV感染と非HIV感染結核症例からの結核菌分離株について行われた遡及的観察研究であった。遺伝子型決定結果を国際スポリタイピングデータベース,SITVIT2と比較し,それに応じて分類した。MERCATプログラムを用いて,スポリフォレストを作成した。遺伝子型に依存してクラスター化または非クラスター化としてspoligo型パターンを分類し,クラスタリングの割合と最近の伝達指数(RTIn-1)を推定した。HIV集団における人口統計的,臨床的および行動的変数とクラスタ化の間の粗会合を分析した。【結果】2010年から2014年まで,合計479人の患者を,研究部位での培養によって結核症例として確認した。Spoligoタイプパターンは391人の患者(82%)から利用可能であり,そのうちの9人は研究に含まれた。71のspoligo型パターンを検出し,全体的に,最も高頻度のspoligoタイピングファミリーはLAM(39%),次いでT(22%),Haarlem(14%),X(13%),未知(6%)および北京(3%)であり,分離株の97%を示した。400分離株のうち,365(91%)は36クラスター(範囲:2~92)にグループ分けされた。最近の伝送指数(RTIn-1)は82%であった。肺結核は,利用可能なデータ(OR=4.3,95%CI1.0-17.7)を有する113のHIV感染群におけるクラスタ化と強く関連していた。【結語】Guatemala市におけるM.tuberculosisの進行中の伝播の高レベルがあり,Guatemalaは簡便標本におけるクラスタ化によって示される。HIV感染患者の間で,クラスタ化は肺疾患においてよりそうであった。【JST・京大機械翻訳】
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分類 (2件):
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感染症・寄生虫症一般  ,  疫学 

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