コンセンサスアプローチを用いた蛋白質-蛋白質ドッキングポーズの集合【JST・京大機械翻訳】

Launay, G.; Ohue, M.; Prieto Santero, J.; Matsuzaki, Y.; Hilpert, C.; Uchikoga, N.; Hayashi, T.; Martin, J.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202205032911981 整理番号：22P0232694

コンセンサスアプローチを用いた蛋白質-蛋白質ドッキングポーズの集合【JST・京大機械翻訳】

Rescoring ensembles of protein-protein docking poses using consensus approaches

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発行年： 2020年05月05日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2020年05月05日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

※このプレプリント論文は学術誌に掲載済みです。なお、学術誌掲載の際には一部内容が変更されている可能性があります。

スコーリングは蛋白質-蛋白質ドッキングにおける困難な段階であり,典型的には数千の溶液が生成される。成功したスコアリングは,生成界面の物理化学的評価および/または既知の界面特性を再現する統計的ポテンシャルに基づく。他のルートはコンセンサスベースの再スコアリングによって提供され,そこでは,解の集合を用いて,反復解を同定するために統計を構築する。ベンチマーク4のためのZDOCKデコイセットに関するコンセンサスベースの再スコアリングを実行するいくつかの方法を調査した。界面サイズの情報は,成功裏の修復に重要であることを示した。ZDOCKネイティブスコアリング関数とコンセンサスベース再スコアリングを組み合わせて,これが初期結果を改善することを示した。【JST・京大機械翻訳】

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, , , , 【Automatic Indexing@JST】

分子・遺伝情報処理 , 分子化合物

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