異系交配植物集団内の遺伝子発現のシスとトランス調節を形成する進化力【JST・京大機械翻訳】

Josephs, E. B.; Lee, Y. W.; Wood, C. W.; Schoen, D.; Wright, S.; Stinchcombe, J.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202205092016884 整理番号：22P0258727

異系交配植物集団内の遺伝子発現のシスとトランス調節を形成する進化力【JST・京大機械翻訳】

The evolutionary forces shaping cis and trans regulation of gene expression within a population of outcrossing plants.

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発行年： 2020年02月11日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2020年02月11日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

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個体群内の遺伝的変異の持続性を理解することは,進化生物学の目標である。この目標を達成するための1つの有望な経路は,形質変異と関連する遺伝子座に選択がどのように作用するかを記述するための集団遺伝学的アプローチを用いることである。遺伝子発現は,遺伝子発現がどのように形質に影響するかに関する情報なしでゲノムワイドに測定できるので,変異の維持の課題に取り組むためのモデル形質を提供する。以前の研究は,近隣遺伝子(局所またはシス-eQTL)の発現に影響する遺伝子座が負の選択下にあるが,トランスの遺伝子発現に影響する変異体に作用する選択的力の明確な理解を欠いていることを示した。ここでは,偏性交配植物であるCapsella grandifloraの1個体群からゲノムおよびトランスクリプトミクスデータを用いてトランスの遺伝子発現に影響を及ぼす遺伝子座を同定した。trans-eQTLの対立遺伝子頻度はシス-eQTLよりもトランス-eQTLに作用する強い負の選択と一致し,複数の遺伝子の発現に関連するtrans-eQTLsにおいてさらに強くなった。しかし,この一般的なパターンにもかかわらず,同じ共発現モジュールにおける多数の遺伝子の発現に影響する中間周波数におけるtrans-eQTLの存在を観察した。全体として,著者らの研究は,シス-およびトランス-遺伝子調節における異なる選択的圧力形成変化を強調する。【JST・京大機械翻訳】

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, , , , , 【Automatic Indexing@JST】

遺伝子発現 , 遺伝子の構造と化学 , 集団遺伝学 , 遺伝学研究法

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