イランから分離されたBordetella parapertussisのゲノム特性【JST・京大機械翻訳】

Safarchi, A.; Saedi, S.; Tay, C. Y.; Lamichhan, B.; Nakhost Lotfi, M.; Shahgheraghi, F.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202205171500660 整理番号：22P0031776

イランから分離されたBordetella parapertussisのゲノム特性【JST・京大機械翻訳】

Genome characteristic of Bordetella parapertussis isolated from Iran

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発行年： 2022年01月06日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年01月06日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

百日咳は,特に乳児におけるヒトにおける呼吸器感染症であり,通常Bordetella百日咳によって引き起こされる。しかし,Bordetella parapertussisも同様の臨床症候群を引き起こす。2012年から2015年の間に,百日咳確認のためのイランのPasture Institutesの百日咳基準研究所に異なる省から送られた鼻スワブから,7つのB.parapertussis分離株を,細菌培養,生化学試験,およびリアルタイムPCRによるゲノムにおけるIS1001挿入の存在によって同定した。さらに,細菌接着の主要な毒性因子としてのパータクチン(Prn)の発現をウェスタンブロットを用いて調べた。さらに,7箇月の乳児からの1つの最近集められた分離株,IRBP134のゲノム特性を,Illumina NextSeq配列決定プロトコルを使用して調査した。結果は,G+C含有量65%とゲノムサイズ4.7Mbpのゲノムを明らかにした。全部で81の一塩基多型(SNP)と13の短い挿入と欠失が,この分離株で進行中の進化変化を示す参照ゲノムとしてB.parapertussis 12822と比較してゲノムに見出された。また,IRBP134の系統発生関係を,グローバルB.parapertussis利用可能なゲノムを用いて調べた。【JST・京大機械翻訳】

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, , , , , , 【Automatic Indexing@JST】

感染症・寄生虫症一般 , 微生物検査

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