異なるMDCK細胞株で直列に継代したインフルエンザAウイルスは,血球凝集素遺伝子の例外を伴うゲノム全体で限定された配列変異を示す【JST・京大機械翻訳】

Barnard, K. N.; Wasik, B. R.; Alford-Lawrence, B. K.; Hayward, J. J.; Weichert, W.; Voorhees, I. E. H.; Holmes, E. C.; Parrish, C. R.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202205205281377 整理番号：22P0226497

異なるMDCK細胞株で直列に継代したインフルエンザAウイルスは,血球凝集素遺伝子の例外を伴うゲノム全体で限定された配列変異を示す【JST・京大機械翻訳】

Influenza A viruses serially passaged in different MDCK cell lines exhibit limited sequence variation across their genomes, with the exception of the hemagglutinin gene

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発行年： 2020年02月23日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2020年02月23日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

深い配列分析のための新しい方法は,リアルタイムでウイルス突然変異の出現と動態を追跡する機会を提供する。ウイルスは,研究およびワクチン開発のために細胞培養で一般的に増殖しているが,ウイルスを増殖するために使用される細胞は,しばしば同じ組織またはウイルスが自然に複製する同じ宿主から誘導されない。in vitroでの培養ウイルスの選択的圧力は,まだ部分的にしか理解されていない。MDCK細胞はインフルエンザウイルスの増殖のための標準細胞であるが,イヌ腎臓の上皮に由来し,また不均一である。ヒトH3N2,H1N1パンデミック,およびイヌH3N2インフルエンザAウイルス(IAV)をMDCK細胞の異なる系統において,また,2,3-および2,6-結合またはN-グリコリルノイラミン酸(Neu5Gc)またはN-アセチルノイラミン酸(Neu5Ac)型を含む変異体Sia受容体を発現するように操作した系統と同様に継代した。MDCK型II細胞は,低い感染効率およびウイルス産生を有し,感染はウイルスのプロテアーゼ活性化によりより依存した。ウイルスが異なる細胞で継代されたとき,それらは少数のコンセンサスレベル突然変異のみを示し,ほとんどはHA遺伝子内であった。両ヒトIAVは,Neu5Gcを発現する細胞で継代したウイルスのHA受容体結合部位における低頻度変異体と同様に,細胞型のHA幹における単一ヌクレオチド少数変異体に対する選択を示した。また,イヌH3N2はNeu5Gcを発現する細胞における受容体結合部位近くの少数変異体を示し,また,2,6-結合を発現した。IMPORTANCEは,ウイルスの遺伝的変異と適応性は,異なる宿主環境と免疫応答の面での進化成功を可能にする基本的性質である。細胞培養におけるウイルスの成長は,それらの研究およびワクチンの調製に広く使用されている。しかし,ウイルスに細胞継代を課す選択圧力はよく理解されていない。深部配列分析を用い,3種類の異なるインフルエンザAウイルスが,それらの増殖に通常使用されるイヌMDCK細胞の異なる系統で,また,それらの細胞表面受容体,シアル酸の異なる形態を発現するようにエンジニアリングした変異体細胞の異なる系統での継代にどのように反応するかを明らかにした。この分析は,ほとんどの変異がHA遺伝子で生じ,ウイルス集団における配列変化が高比率に達することを明らかにした。これは,細胞培養におけるウイルス増殖の選択圧と,それが進化パターンをどのように形作るかを理解するのに適切である。【JST・京大機械翻訳】

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ウイルス感染の生理と病原性 , 免疫療法薬・血液製剤の基礎研究

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