ヘルスケア関連COVID-19感染を研究するためのリアルタイムSARS-CoV-2配列決定の迅速な実施【JST・京大機械翻訳】

Meredith, L. W.; Hamilton, W. L.; Warne, B.; Houldcroft, C. J.; Hosmillo, M.; Jahun, A.; Curran, M. D.; Parmar, S.; Caller, L.; Caddy, S. L.; Khokhar, F. A.; Yakovleva, A.; Hall, G. R.; Feltwell, T.; Forret, S. N.; Sridhar, S.; Weekes, M. p.; Baker, S.; Brown, N.; Moore, E.; Gouliouris, T.; Popay, A.; Roddick, I.; Reacher, M.; Peacock, S.; Dougan, G.; Torok, M. E.; Goodfellow, I.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202205209967060 整理番号：22P0263969

ヘルスケア関連COVID-19感染を研究するためのリアルタイムSARS-CoV-2配列決定の迅速な実施【JST・京大機械翻訳】

Rapid implementation of real-time SARS-CoV-2 sequencing to investigate healthcare-associated COVID-19 infections

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資料名：
発行年： 2020年05月14日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2020年05月14日
JST資料番号： O7002B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

【背景】健康管理関連のCOVID-19感染の負担と影響は不明である。医療関連COVID-19感染を調査し,感染制御対策を知らせるため,詳細な疫学的分析と組み合わせたSARS-CoV-2の迅速配列決定の有用性を検討した。【方法】著者らは,ナノポア配列決定を用いてPCR陽性診断試料からSARS-CoV-2の迅速ウイルス配列決定をセットアップして,サンプルからシーケンスを24時間未満に可能にした。医療関連COVID-19の疑わしい症例を調査するために,ゲノムと疫学的データの統合による迅速なレビューと報告システムを確立した。【結果】2020年3月13日と24月24日の間に,著者らはイングランドの東の5191人のCOVID-19患者から臨床データとサンプルを採取した。1000試料を配列決定し,747の完全なウイルスゲノムを作成した。当院で299人の患者の疫学的およびゲノム分析を行い,114人の患者を含む26のゲノムクラスターを同定した。66症例(57.9%)は,強い疫学的関連があり,15症例(13.2%)は,妥当な疫学的関連があった。これらの結果は,臨床,感染管理および病院管理チームにフィードバックされ,感染制御介入および患者の安全報告のインフォームをもたらした。結論:著者らは,英国病院におけるSARS-CoV-2のリアルタイムゲノムサーベイランスを確立し,医療関連COVID-19感染の調査のためのゲノムおよび疫学的分析の組み合わせの利点を示した。このアプローチにより,陰窩伝染事象を検出し,さらなる健康管理関連感染を低減するための感染制御介入の機会を同定することができた。【JST・京大機械翻訳】

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, , , , , 【Automatic Indexing@JST】

感染症・寄生虫症一般

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