抄録/ポイント：
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アシネトバクターbaumanniiは,現在,臨床設定の外であまり明確でない貯留層の重要な院内病原体である。ここでは,砂漠グアユール潅木の好気性分解(retting)から1943年に分離されたAcinetobacter sp.NCIMB8209収集株の全ゲノム配列決定分析を行った。NCIMB8209は3.75Mb染色体と134kbのプラスミドを含んでいた。コア遺伝子に基づく系統解析は,A.baumanniiへのNCIMB8209の親和性を示し,染色体blaOXA-51様遺伝子の同定により支持された。抗菌耐性決定因子を欠く7つのゲノム島,ファージ関連遺伝子を含む5つの領域,特に93の挿入配列(IS)がこのゲノムにおいて見出された。NCIMB8209は,現代のA.baumannii臨床株で記載された持続性と病原性にリンクした多くの遺伝子を有するが,それらの多くは,ISによって,表面構造の構成要素をコード化している。さらに,6型分泌系またはクリスプ/casのような生物学的攻撃者に対する防御遺伝子島は,このゲノムからは存在しなかった。これらの知見は,NCIMB8209の低い容量と相関し,バイオフィルムとペリクルを形成し,半固体培地で低運動性で,Galleria mellonellaとCaenorhais elegansに対して低毒性である。異化遺伝子および同時代謝アッセイの探索は,NCIMB8209が,外部攻撃者に対する芳香族酸および防御化合物を含む植物によって産生される広範囲の物質上で増殖することを明らかにした。上記のすべての特徴は,NCIMB8209が特定の環境ニッチに特異的適応特徴を進化させることを示唆する。さらに,それらは現代のA.baumannii臨床株で同定された顕著な遺伝的可塑性が種の固有の特性を表すことを明らかにした。IMPORTANCEAcetobacter baumannii(Ab)はESKAPE日和見病原体であり,臨床設定の外であまり明確でない自然生息地/貯水池である。Abは,集団ボトルネックの結果としてAcb複合体から生じ,その後,耐性および病原性遺伝子のアルセナールに付与された少数の臨床関連クローンからの最近の集団拡大が続いた。それでも,病原性生活様式につながる病原性形質と進化経路の同定は不明であり,従って,非臨床(”環境”)Ab分離株の研究は必要である。ここでは,グアユールの分解に関与する微生物相から1943年に分離されたAb NCMBI8209に関する比較ゲノムおよび病原性研究を実施し,従って今日の優勢な多剤耐性株から時間的および疫学的に区別した。本研究は,宿主防御から逃れるためにAbによって使用される適応戦略に関する洞察を提供し,そのさらなる普及を制限することを目指した対策の採用を助けるかもしれない。【JST・京大機械翻訳】
