拒絶腎臓移植における免疫細胞キメラ性を定義するための発現単一ヌクレオチド変異と単一細胞RNA配列決定の利用【JST・京大機械翻訳】

Malone, A. F.; Wu, H.; Fronick, C.; Fulton, R.; Gaut, J. P.; Humphreys, B. D.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202205378279912 整理番号：22P0228248

拒絶腎臓移植における免疫細胞キメラ性を定義するための発現単一ヌクレオチド変異と単一細胞RNA配列決定の利用【JST・京大機械翻訳】

Harnessing Expressed Single Nucleotide Variation and Single Cell RNA Sequencing to Define Immune Cell Chimerism in the Rejecting Kidney Transplant

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発行年： 2020年03月11日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2020年03月11日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

※このプレプリント論文は学術誌に掲載済みです。なお、学術誌掲載の際には一部内容が変更されている可能性があります。

固形臓器移植では,ドナー由来免疫細胞は,手術後に時間と共に低下すると考えられている。ドナー白血球が腎臓移植内に持続するか,または拒絶において何らかの役割を果たすかどうかは,レシピエントとドナー細胞を区別するための限られた技術のため,一部は知られていない。この疑問に取り組むために,著者らは5つのヒト腎臓移植生検コアのドナーおよびレシピエントDNAおよび単一細胞RNA配列決定(scRNA-seq)の対全エキソーム配列決定を行った。エキソーム配列を用いて,すべてのサンプルで単一ヌクレオチド変異(SNV)を定義した。scRNA-seqデータセットにおける発現SNVを分析することによって,著者らは,すべての81,139細胞に対してレシピエント対ドナー細胞起源を定義することができた。レシピエントに対する白血球ドナーは,マクロファージに対する拒絶状態およびリンパ球に対する移植後の時間により変化した。レシピエントマクロファージは,抗原提示と補体シグナリングによって,炎症性活性化とドナーマクロファージによって特徴づけられた。レシピエント由来T細胞はエフェクター細胞表現型と一致する細胞毒性および炎症誘発性遺伝子を発現したが,ドナー起源T細胞はレシピエントT細胞に比べて酸化的リン酸化遺伝子を発現すると思われる。最後に,ドナーとレシピエントT細胞クローンの両方が拒絶腎臓内に存在し,リンパ凝集を示唆した。著者らの結果は,ドナー起源マクロファージとT細胞がレシピエント対応物と比較して異なる転写プロファイルを持ち,ドナーマクロファージが移植後数年間持続することを示した。本研究は,単一細胞解像度で転写プロファイルを調べる能力と結合した腎臓移植のような複雑な組織における白血球キメラを正確に定義するためのこのアプローチの力を実証する。【JST・京大機械翻訳】

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血液の腫よう , 移植免疫

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