RNA結合蛋白質CELF1とELAVL1は選択的スプライシングを協調的に制御する【JST・京大機械翻訳】

David, G.; Reboutier, D.; Deschamps, S.; Mereau, A.; Taylor, W.; Padilla-Parra, S.; Tramier, M.; Audic, Y.; Paillard, L.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202205437052358 整理番号：22P0257003

RNA結合蛋白質CELF1とELAVL1は選択的スプライシングを協調的に制御する【JST・京大機械翻訳】

The RNA-binding proteins CELF1 and ELAVL1 cooperatively control alternative splicing

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発行年： 2020年02月20日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2020年02月20日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

ELAVL1とCELF1は選択的スプライシング制御に関与するRNA結合蛋白質である。それらの機能的関係を探索するために,CELF1,ELAVL1または両方の枯渇後に差次的にスプライスされるmRNAを調べた。これらの蛋白質は,同じ方向でそれらの標的エキソンの使用を制御することを見出した。二重枯渇は個々の枯渇より大きな効果を持ち,CELF1とELAVL1が相加的制御を発揮することを示した。これらの結果を確認するために,CD44,WNK1,PHACTR2,MICAL3,SPTBN1,およびPPP3CBを含むいくつかのmRNAの代替カセットエキソンについてRT-PCRを行った。FRETを用い,CELF1とELAVL1が細胞核で直接相互作用することを見出した。CELF1とELAVL1の併用レベルは,それらの個々のレベルが非常に限られた情報を生じる場合でも,いくつかの癌における貴重なバイオマーカーであることを示した。CD44代替スプライシングは,おそらく患者生存に対するCELF1とELAVL1レベルの影響の一部を説明する。これらのデータは,mRNAイソ型産生の制御におけるCELF1とELAVL1の間の強い機能的相互作用を示し,ヒト病理学に著しい影響を与える。【JST・京大機械翻訳】

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遺伝子発現

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