Acinetobacter baumanniiのカルバペネム耐性に関連する可動性遺伝要素のゲノム再構成【JST・京大機械翻訳】

Vijayakumar, S.; Jacob, J. J.; Vasudevan, K.; Mathur, P.; Ray, P.; Neeravi, A. R.; Baskaran, A.; Kirubananthan, A.; Anandan, S.; Biswas, I.; Walia, K.; Veeraraghavan, B.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202205462107108 整理番号：22P0314282

Acinetobacter baumanniiのカルバペネム耐性に関連する可動性遺伝要素のゲノム再構成【JST・京大機械翻訳】

Genomic rearrangements of mobile genetic elements associated with carbapenem resistance of Acinetobacter baumannii

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発行年： 2022年02月03日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年02月03日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

過剰なゲノム可塑性により,Acinetobacter baumanniiは,移動性遺伝要素(MGE)としばしば関連する抗菌耐性遺伝子を獲得および分離する能力を持っている。耐性遺伝子の遺伝的環境を分析することは,しばしば,耐性の起源,発生,進化および広がりに関する貴重な情報を提供する。このように,カルバペネム耐性A.baumanniiのいくつかの臨床分離株のゲノム特徴を特性化し,カルバペネム耐性遺伝子の播種に関与する多様なMGEの役割とその遺伝的状況を理解した。このために,2018年から2019年の間にインドの複数の病院から得たA.baumanniiの全部で17の臨床分離株を分析した。抗生物質耐性決定因子,耐性遺伝子の遺伝的状況および分子疫学を全ゲノム配列決定を用いて調べた。blaOXA-23の高い罹患率が観察され,次いで二重カルバペネマーゼ,blaOXA-23およびblaNDMの存在が続いた。3つの新規Oxford配列型を同定した。分離株の大部分は,優性クローン,IC2に属し,IC7およびIC8のような一般的でないクローンが続いた。IC2系統に属する複雑な多様なAbaR4様およびAbGRI様島を同定した。知る限りでは,これは,MGEと共に耐性アイランドの包括的なプロファイリングを提供する最初の研究であり,インドからカルバペネム耐性A.baumanniiのクローン系統の分布を得た。【JST・京大機械翻訳】

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微生物生理一般 , 感染症・寄生虫症一般

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