Zelligeソフトウエアツールによる複雑な生体組織における3D顕微鏡画像からの多重表面の抽出【JST・京大機械翻訳】

Trebeau, C.; Boutet de Monvel, J.; Altay, G.; Tinevez, J.-Y.; Etournay, R.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202205492934815 整理番号：22P0330436

Zelligeソフトウエアツールによる複雑な生体組織における3D顕微鏡画像からの多重表面の抽出【JST・京大機械翻訳】

Extracting multiple surfaces from 3D microscopy images in complex biological tissues with the Zellige software tool.

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発行年： 2022年04月22日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年04月22日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

3D顕微鏡データからの2D表面の抽出を可能にする効率的なツールは,上皮形態形成が発生時に起こる複雑な細胞クロマトグラフィーを解読することを目的とする研究に不可欠である。ほとんどの既存の方法は,十分に高い信号強度とコントラストの単一で滑らかな多様体の抽出を可能にし,通常,興味の面が粗いトポグラフィーを持つか,あるいはその局在化がより高いコントラストの他の周囲の構造によって妨げられるとき,通常失敗する。多重表面セグメンテーションは,様々な表面を別々に手動で注釈する。この作業を自動化するのは,組織-組織または組織-マトリックス相互作用を含む研究において重要であるので,Zelligeソフトウェアを開発し,3D画像から変化する傾斜,コントラスト,およびテクスチャの非記述数の抽出を可能にする。このツールは,Fijiプラグインとして実装された直感的インタフェイスを提供する,小さなセットの制御パラメータの調整を必要とする。Zelligeの多用途性の原理の証明として,著者らは合成画像に関するその性能とロバスト性,および広範囲の生物学的状況をカバーする4種類の生物学的サンプルについて示す。【JST・京大機械翻訳】

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, , 【Automatic Indexing@JST】

図形・画像処理一般

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