非酵素的鋳型指向重合に及ぼすthreo-ヌクレオチドの影響の構造的解釈【JST・京大機械翻訳】

Zhang, W.; Kim, C.; Tam, C. P.; Lelyveld, V.; Bala, S.; Chaput, J.; Szostak, J. W.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202205575099470 整理番号：22P0253451

非酵素的鋳型指向重合に及ぼすthreo-ヌクレオチドの影響の構造的解釈【JST・京大機械翻訳】

Structural interpretation of the effects of threo-nucleotides on nonenzymatic template-directed polymerization

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発行年： 2020年11月17日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2020年11月17日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

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リボヌクレオチドのプレバイオティクス合成は,TNAのthreo-ヌクレオチド構築ブロックを含む非標準ヌクレオチドの合成を伴うようである。ここでは,非酵素鋳型指向重合に関与する活性化threo-ヌクレオチドの能力を調べた。多重逐次threo-ヌクレオチド単量体によるプライマー伸長はリボヌクレオチドに比べて強く不利であることを見出した。速度論,NMRおよび結晶学的研究は,これがプライマー伸長におけるイミダゾリウム架橋TNAジヌクレオチド中間体の遅い形成と,部分的には,攻撃RNAプライマー3-ヒドロキシルと流入するthreo-ヌクレオチド中間体のリン酸塩との間のより大きな距離に起因することを示唆する。活性化下流RNAオリゴヌクレオチド存在下での単一活性化threo-ヌクレオチドは,活性化リボヌクレオチドよりも10倍ゆっくりとプライマーに加えた。対照的に,RNAプライマーの末端またはRNA鋳型における単一活性化threo-ヌクレオチドは,結晶構造によって明らかにされたマイナーおよび局所構造歪みと一致して,プライマー伸長速度のわずかな減少をもたらした。結果は,複製のサイクルを通して,不均一原始オリゴヌクレオチドが,ますます均一なRNA鎖を生じるモデルと一致する。【JST・京大機械翻訳】

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