トポロジーデータ解析を用いた癌における関連遺伝的変異の同定【JST・京大機械翻訳】

Rabadan, R.; Mohamedi, Y.; Rubin, U.; Chu, T.; Elliott, O.; Arnes, L.; Cal, S.; Obaya, A. J.; Levine, A. J.; Camara, P. G.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202205583617162 整理番号：22P0224424

トポロジーデータ解析を用いた癌における関連遺伝的変異の同定【JST・京大機械翻訳】

Identification of Relevant Genetic Alterations in Cancer using Topological Data Analysis

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発行年： 2020年01月31日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2020年01月31日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

※このプレプリント論文は学術誌に掲載済みです。なお、学術誌掲載の際には一部内容が変更されている可能性があります。

大規模な癌ゲノム研究は,腫瘍の発生および進行に導く変異の系統的同定を可能にし,根底にある分子機構および潜在的治療法を明らかにする。いくつかのそのような突然変異は多くの腫瘍で再発性に見出されるが,多くの他は,従来の再発に基づく統計的アプローチによる検出を除外して,少数のサンプル内にのみ存在する。12の腫瘍タイプにわたる体細胞変異とRNA発現データの統合分析は,癌遺伝子の変異が,通常,発現の実質的な変化を伴うことを明らかにした。この観察を活用し,肺腺癌におけるメタロプロテイナーゼADAMTS12の不活性化変異を含む38の不明の候補癌関連遺伝子を明らかにするため,トポロジーデータ解析を用いた。ADAMTS12 ̄-/-マウスは肺腫瘍発生に対する感受性の5倍増加を示し,腫瘍抑制遺伝子としてのADAMTS12の役割を確認した。結果は,トポロジー技術によるデータ統合が,以前に報告されていない癌と関係した変化を同定する我々の能力を増加することを示す。【JST・京大機械翻訳】

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, , , 【Automatic Indexing@JST】

基礎腫よう学一般 , 遺伝的変異

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