Populus tomentosa Carr.の雑種起源はゲノム配列決定と系統発生解析により同定される【JST・京大機械翻訳】

An, X.; Gao, K.; Chen, Z.; Li, J.; Yang, X.; Zhou, J.; Guo, T.; Zhao, T.; Huang, S.; Miao, D.; Khan, W. U.; Rao, P.; Ye, M.; Lei, B.; Liao, W.; Wang, J.; Ji, L.; Li, Y.; Guo, B.; Mustafa, N. S.; Li, S.; Yun, Q.; Keller, S. R.; Mao, J.; Zhang, R.; Strauss, S. H.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202205628550013 整理番号：22P0230917

Populus tomentosa Carr.の雑種起源はゲノム配列決定と系統発生解析により同定される【JST・京大機械翻訳】

Hybrid origin of Populus tomentosa Carr. identified through genome sequencing and phylogenomic analysis

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資料名：
発行年： 2020年04月09日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2020年04月09日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

Populus tomentosaは中国北部と中央中国で広く分布し栽培され,そこでは大きな経済的および生態学的重要性がある。しかし,P.tomentosaの起源は議論の余地がある。ここでは,PacBio+Hi-C+Illumina戦略を用いて,その740.2Mb(2n)ゲノムを配列し,組み立てた。アセンブリは800メガ塩基ゲノムの92.1%以上を占め,38の染色体から成り,59,124の注釈付き蛋白質コード遺伝子を含む。Phylogenomic分析は,その近縁白色ポプラ間の動的ゲノム進化事象を明らかにし,トメントサが2つのサブゲノムから成り,そのことが,雌としてPopulus adenopodaと,雄としてPopulus alba var.ピラミッドとの交雑から生じ,約3.93Myaであることを示した。また,ゲノムを通して構造変化と対立遺伝子-インデルを検出した。本研究は,高品質でよく組み立てられたゲノムを提示し,広く分布し,植えられたP.tomentosaの起源を明らかにし,比較植物生物学,育種,およびバイオテクノロジーのための強力な資源を提供する。【JST・京大機械翻訳】

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, , , , 【Automatic Indexing@JST】

遺伝子の構造と化学 , 植物の生化学

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