抄録/ポイント：
抄録/ポイント
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Pneumoniaは,米国だけで毎年12億ドルの感染性関連死の主因である。臨床治療の改善にもかかわらず,全死亡率は約4%であり,入院患者死亡率は5~10%に達した。未知の理由のために,死亡リスクは退院後でさえ高いままであり,リスクでそれらの患者を同定する必要がある。また,重要なこととして,臨床症状のみは,適切な治療を遅らせ,短期および長期死亡率に寄与する可能性がある細菌感染からウイルスを区別しない。バイオマーカーは,医療診断のポイントを提供し,ハイリスク患者を同定し,疾患の生物学の理解を増加させる可能性がある。しかし,今日まで試験した多くの検体の診断性能に関する混合結果があった。尿は,バイオマーカー発見のための主に未利用の源であり,非常にアクセス可能である。この仮説を検証するために,著者らは,地域感染性肺炎(CAP)の入院患者から尿を採取し,尿路微生物叢の特徴,代謝産物,およびサイトカインプロファイルのための包括的スクリーニングを行った。CAP患者はインフルエンザまたは細菌(S.aureusおよびS.pneumoniae)の病因と診断され,健常ボランティアと比較した。マイクロバイオームシグネチャーは,細菌病因対インフルエンザおよびCAP対正常の患者における分類学的レベルで顕著なシフトを示した。291の微生物と代謝物値の予測モデリングは,特定の肺炎病因の予測においてLASSOで+90%の精度を達成した。この研究は,肺炎で入院した患者からの尿が,病因を診断し,臨床転帰を予測するバイオマーカーを評価する,信頼できてアクセス可能な試料として役立つことを示す。Author Summaryurineは,ほとんどの微生物が健康環境下で容易に培養できないので,古典的に無菌と考えられている。さらに,多くの肺炎患者は,抗生物質レンダリング培養ベース技術に直ちに置かれている。しかしながら,次世代シークエンシングの出現は,微生物群落の前例のない分析を可能にし,ヒト体の多くのニッチで遊離DNAとして検出される。ここでは,健康な対照と比較し,インフルエンザまたは細菌(S.aureusおよびS.pneumoniae)感染肺炎と診断された病院に新たに入院した患者で測定した代謝物およびサイトカインと同様に,尿ミクロビオームを報告する。これらのパラメータのみを用いて,患者肺炎の予測において高い成功を成し遂げることができた。本研究は,外来患者と入院患者の設定に容易にアクセスできる尿サンプルが,患者の感染状態と合併症の将来の危険因子への更なる診断洞察を提供するという概念の証明を提供する。【JST・京大機械翻訳】
