プレプリント
J-GLOBAL ID:202202205787791030   整理番号:22P0249505

Legionella pneumophilaの臨床分離菌におけるトランスポゾン挿入配列決定は必須遺伝子および自然形質転換の決定要素を同定する【JST・京大機械翻訳】

Transposon-insertion sequencing in a clinical isolate of Legionella pneumophila identifies essential genes and determinants of natural transformation
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発行年: 2020年10月04日  プレプリントサーバーでの情報更新日: 2020年10月04日
JST資料番号: O7001B  資料種別: プレプリント
記事区分: プレプリント  発行国: アメリカ合衆国 (USA)  言語: 英語 (EN)
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Legionella pneumophilaは淡水環境に遍在するグラム陰性細菌であり,吸入するとヒトに重症肺炎を引き起こす。L.pneumophilaの出現は,環境の中で選択されたいくつかの形質とリンクしており,その幾つかは,内部およびノックダウンの水平遺伝子移動事象を含む。トランスポゾン挿入配列決定(TIS)は,選択可能な形質の遺伝的基礎を同定し,適応決定因子と必須遺伝子,可能な抗生物質標的を同定する強力な方法である。TISは,おそらく高飽和トランスポゾン挿入ライブラリーを得る困難さのため,L.pneumophilaにおける完全電力にはまだ使用されていない。実際,一般的に使用される実験室株に属するST1分離株が,共役仲介トランスポゾンデリバリーによる飽和変異誘発にあまり許容されないことを見出した。対照的に,非ST1臨床分離株において高飽和ライブラリーを得て,非変化L.pneumophila株に対するTISの使用の展望を提供した。それらのうちの1つに焦点を当て,TISを用いてL.pneumophilaの必須遺伝子を同定した。また,TISは移動性遺伝要素の垂直伝達を制御する遺伝子の同定に使用できることを明らかにした。次に,TISを適用して,L.pneumophilaに必要な全ての遺伝子を同定し,DNA取込みに関与する主要およびマイナー型IV型ピリンのセットを定義する,能力を開発し,自然形質転換を行った。本研究は,TISによるL.pneumophilaゲノムの機能的探索と,この種の他の生命形質の遺伝的基礎の同定のための道を開く。重要性Legionella pneumophilaは,ヒトにおける院内および地域感染性肺炎の重症型の病原体である。L.pneumophilaは,感染の発生源である人工および淡水環境において見出される。L.pneumophilaの環境生活形質は,バイオフィルムを形成する能力,殺生物剤および単細胞捕食者に抵抗し,ヒトに感染するその能力に必須である。これらの生命形質の遺伝的基礎の包括的同定は,トランスポゾン挿入配列決定の使用により得ることができた。しかし,この強力なアプローチはL.pneumophilaにおいて完全には実施されていない。ここでは,L.pneumophilaの臨床分離株におけるトランスポゾン配列決定アプローチの成功した実施について述べた。自然形質転換による水平遺伝子導入に必要な必須遺伝子,潜在的薬物標的および遺伝子を同定した。本研究は,この環境および病原性種の多くの生命形質の遺伝的基礎を同定する重要な段階である。【JST・京大機械翻訳】
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分類 (1件):
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遺伝子の構造と化学 

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