プレプリント
J-GLOBAL ID:202202205796324118   整理番号:22P0319002

造礁サンゴの全長トランスクリプトームマップは石灰化,共生および概日遺伝子の分子的基礎を照らす【JST・京大機械翻訳】

Full-length transcriptome maps of reef-building coral illuminate the molecular basis of calcification, symbiosis, and circadian genes
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発行年: 2022年03月25日  プレプリントサーバーでの情報更新日: 2022年03月25日
JST資料番号: O7001B  資料種別: プレプリント
記事区分: プレプリント  発行国: アメリカ合衆国 (USA)  言語: 英語 (EN)
抄録/ポイント:
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【背景】珊瑚礁は珊瑚礁を維持するための重要な種であり,地球規模の気候変動によって高度に脅かされている。しかし,関連するトランスクリプトミクスデータは,主に,サンゴ分子機構の理解を厳しく制限し,未解決の多くの重要な生物学的疑問を残す,短読配列に依存する。【結果】著者らは,PacBio Sequel IIプラットフォームを用いて,2つの頑丈なクレード種,Pocillopora damicornisとPocillopora verrucosa,および2つの複雑なクレード種,Acropora muricataとMontipora foliosaを含む,4つの一般的で頻繁に優勢な礁形成サンゴの完全長トランスクリプトームを配列決定した。遺伝子機能,構造および発現プロファイルに関する情報を得た。それらの中で,バイオミネラリゼーション関連遺伝子の比較分析はサンゴ骨格密度の分子基盤への洞察を与えた。共生Symbiodiniaceaeの遺伝子発現プロファイルも単離し,ホロビオント配列データから注釈した。これらのプロファイルは,サンゴ宿主より遺伝子構造と発現レベルに関連するより高度に収束した形質を示した。興味深いことに,細胞内藻類細胞はサンゴにおける細胞内共生とナメクジウオにおける細胞内消化の間のいくつかの進化的収束を共有することを観察した。最後に,27の進化的代表種間の重要な概日時計遺伝子の系統発生解析は,cry遺伝子を含む初期後生動物に4つの重要メンバーがあることを示した。クロックまたはNpas2;cycまたはArntl;そして,第5のメンバーとして,Bilateriaにおいて発生する。【結論】著者らの研究は,短読配列の不完全性を克服して,石灰化,共生,および概日性遺伝子の分子的基礎を明らかにして,このように,これらの重要な生物の生存を促進するために,骨格生産または共生の操作に関する更なる研究のための基礎を提供する。【JST・京大機械翻訳】
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分類 (2件):
分類
JSTが定めた文献の分類名称とコードです
動物に対する影響  ,  個体群生態学 

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