進化的に保存された平滑筋細胞特異的lncRNA CARMNの発見【JST・京大機械翻訳】

Dong, K.; Shen, J.; He, X.; Wang, L.; Hu, G.; Bunting, K. M.; Dixon-Melvin, R.; Zheng, Z.; Xin, H.; Xiang, M.; Vazdarjanova, A.; Zhou, J.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202205810918255 整理番号：22P0224512

進化的に保存された平滑筋細胞特異的lncRNA CARMNの発見【JST・京大機械翻訳】

Discovery of an evolutionarily conserved smooth muscle cell-specific lncRNA CARMN

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発行年： 2020年01月31日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2020年01月31日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

分化した血管平滑筋細胞(VSMCs)は,収縮遺伝子のユニークなレパートリーを発現することにより,血管ホメオスタシスの維持に重要である。分化したVSMCsにおける明確なコードトランスクリプトームにもかかわらず,非コード遺伝子発現シグネチャについてはほとんど知られていない。ここでは,異なる組織および細胞型から生成された,公的に利用可能なRNA-seqおよび単一細胞RNA-seqデータセットをde novo分析することにより,進化的に保存されたSMC特異的lncRNAとしてCARMN(CARdiac Mesoderm Enhancer関連非コードRNA)を明確に同定した。CARMNは最初にMIR143/145クラスターの宿主遺伝子として注釈され,最近,心臓分化において役割を果たすことが報告されている。ここでは,CarmnGFPノックインレポーターマウスモデルを作成し,in vivoでのSMCsにおけるその特異的発現を確認した。加えて,CarmnはMir143/145から独立して転写され,胚心筋細胞で一過性に発現し,その後ヒトとマウスの両方で成体SMCに制限されることを見出した。さらに,CARMN発現はヒト血管疾患において劇的に減少するだけでなく,in vitroでのVSMC収縮表現型の維持において機能的に重要であることを示した。結論として,CARMNが進化的に保存されたSMC特異的lncRNAであり,異なるヒト血管疾患でダウンレギュレートされ,SMC収縮表現型を維持するための重要なlncRNAであることを示した。【JST・京大機械翻訳】

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, , , 【Automatic Indexing@JST】

細胞生理一般 , 遺伝子発現 , 血管系

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