末梢膜蛋白質と脂質との特異的相互作用:分子シミュレーションは我々に何を示すか?【JST・京大機械翻訳】

Larsen Andreas Haahr; John Laura H.; Sansom Mark S. P.; Corey Robin A.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202205910937567 整理番号：22P0283104

末梢膜蛋白質と脂質との特異的相互作用:分子シミュレーションは我々に何を示すか?【JST・京大機械翻訳】

Specific interactions of peripheral membrane proteins with lipids: what can molecular simulations show us?

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発行年： 2022年02月01日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年02月01日
JST資料番号： O7000B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

※このプレプリント論文は学術誌に掲載済みです。なお、学術誌掲載の際には一部内容が変更されている可能性があります。

末梢膜蛋白質は,細胞シグナル伝達,酵素活性,または膜リモデリングなどの機能を実施するために,生体膜に可逆的かつ特異的に結合できる。これらの蛋白質および脂質結合ドメインの構造は,通常,結合部位で脂質または脂質頭基で可溶性型で解決される。膜との末梢膜蛋白質相互作用の詳細な分子的見解を提供するために,分子動力学(MD)シミュレーションのような計算法を適用できる。ここでは,PIP結合ドメインのような細胞内蛋白質および糖脂質結合細菌エキソトキシンのような細胞外蛋白質の両方に焦点を当て,これらの結合相互作用を特性化する最近の試みを概説した。シミュレーションデータから脂質結合部位を同定し,分析する方法を比較した。自由エネルギー計算を用いてこれらの相互作用のエネルギー論を特徴付ける最近の研究を強調した。方法論と計算力の改善がMDシミュレーションを助け,将来この分野にいかに貢献するかを述べた。【JST・京大機械翻訳】

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生体膜一般 , 蛋白質・ペプチド一般

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