臨床試料中のSARS-CoV-2の迅速検出のためのRNAベースアッセイの開発【JST・京大機械翻訳】

Kumar, V.; Mishra, S.; Sharma, R.; Agarwal, J.; Ghoshal, U.; Khanna, T.; Sharma, L. K.; Verma, S. K.; Tiwari, S.; Mishra, P.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202205922277082 整理番号：22P0240312

臨床試料中のSARS-CoV-2の迅速検出のためのRNAベースアッセイの開発【JST・京大機械翻訳】

Development of RNA-based assay for rapid detection of SARS-CoV-2 in clinical samples

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発行年： 2020年12月05日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2020年12月05日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

汎発性コロナウイルス病(COVID-19)の進行中の広がりは,重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2(SARS-CoV-2)によって引き起こされる。SARS-CoV-2に対する特異的薬物またはワクチンの欠如において,迅速な診断および管理は,コミュニティにおける発生を制御するために重要である。ここでは,ヒト鼻咽頭RNA試料中のSARS-CoV-2を30分未満で検出できる最初の迅速比色アッセイの開発を報告する。オリゴプローブ-標的ハイブリッドの形成が塩誘導凝集と,可視域でのピンクから青色への金-コロイド色の変化をもたらすSARS-CoV-2のRNA依存性RNAポリメラーゼ(RdRp)遺伝子を検出するナノ材料に基づく光学センシングプラットフォームを利用した。したがって,臨床的に診断されたCOVID-19の被験者からの鼻咽頭RNA試料を含むアッセイにおいて,ピンクから青へのコロイド色の変化を見出した。試験がCOVID-19陰性被験者またはヒトパピローマウイルス(HPV)感染女性からの試料を含むとき,コロイドはピンク色を保持した。結果を,疑わしいCOVID-19被験者(n=136)からの鼻咽頭RNAサンプルを用いて検証した。金標準としてRT-PCRを用いて,このアッセイは85.29%の感度と94.12%の特異性を有することが分かった。最適化した方法は,SARS-CoV-2 RNAの0.5ng程度の検出限界を有した。全体として,開発した分析は,臨床試料中のSARS-CoV-2 RNAを費用対効果に優れた方法で迅速に検出でき,マススクリーニングを促進することにより,パンデミック管理に有用である。【JST・京大機械翻訳】

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, , , , , 【Automatic Indexing@JST】

感染症・寄生虫症の診断 , 遺伝子の構造と化学 , ウイルス学一般 , 微生物検査 , ウイルス感染の生理と病原性

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