二重プロテオームスケールネットワークはヒトインタラクトームの細胞特異的リモデリングを明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Huttlin, E. L.; Bruckner, R. J.; Navarrete-Perea, J.; Cannon, J. R.; Baltier, K.; Gebreab, F.; Gygi, M. P.; Thornock, A.; Zarraga, G.; Tam, S.; Szpyt, J.; Panov, A.; Parzen, H.; Fu, S.; Golbazi, A.; Maenpaa, E.; Stricker, K.; Guha Thakurta, S.; Rad, R.; Pan, J.; Nusinow, D. P.; Paulo, J. A.; Schweppe, D. K.; Pontano Vaites, L.; Harper, W.; Gygi, S.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202206032065211 整理番号：22P0223422

二重プロテオームスケールネットワークはヒトインタラクトームの細胞特異的リモデリングを明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Dual Proteome-scale Networks Reveal Cell-specific Remodeling of the Human Interactome

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発行年： 2020年01月19日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2020年01月19日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

※このプレプリント論文は学術誌に掲載済みです。なお、学術誌掲載の際には一部内容が変更されている可能性があります。

相互作用は,細胞プロテオームに空間的および機能的組織化を与えるモジュールに蛋白質を集合する。親和性精製質量分析により,2つのプロテオームスケール,細胞系特異的相互作用ネットワークを作成した。第1,BioPlex3.0は,293T細胞において10,128のヒト蛋白質の親和性精製の結果であり,14586の蛋白質の間で118,162の相互作用を含む。第2の結果はHCT116細胞における522免疫沈降からの結果であった。これらのネットワークは,蛋白質機能,局在化,および複雑なメンバーシップをコードする前例のないスケールでインタラクトームをモデル化する。それらの比較は数千の相互作用を検証し,各ネットワークの広範なカスタマイゼーションを明らかにした。共有相互作用はコア複合体に存在し,必須蛋白質を含むが,細胞特異的相互作用は保存複合体を架橋し,おそらく各細胞インタラクトームを再開する。相互作用を得て,各細胞表現型を生成するプロテオームリモデリングとして共有機能の蛋白質間のタンデムで失われた。BioPlexExplorerを通して,これらのネットワークはプロテオーム組織化の原理を定義し,未知の蛋白質特性化を可能にする。【JST・京大機械翻訳】

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蛋白質・ペプチド一般 , 分子・遺伝情報処理

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