プレプリント
J-GLOBAL ID:202202206069610082   整理番号:22P0314046

遺伝子型表現型と適応景観の不一致について【JST・京大機械翻訳】

On the incongruence of genotype-phenotype and fitness landscapes
著者 (2件):
資料名:
発行年: 2022年05月04日  プレプリントサーバーでの情報更新日: 2022年05月04日
JST資料番号: O7001B  資料種別: プレプリント
記事区分: プレプリント  発行国: アメリカ合衆国 (USA)  言語: 英語 (EN)
抄録/ポイント:
抄録/ポイント
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遺伝子型から表現型へのマッピングは,突然変異の影響を変換できる複数の非線形性を含む。例えば,変異は表現型に相加的に寄与する可能性があるが,その適応性に対する影響は,選択が表現型の低値または中間値を好むので,非相加的に結合する可能性がある。これは,適応景観の地形特性とその根底にある遺伝子型-表現型景観の間の不一致を引き起こす。しかし,遺伝子型-表現型景観は進化のダイナミックスと予測可能性を研究するための適応景観の代理としてしばしば用いられる。ここでは,理論的モデルと転写因子-DNA相互作用に関する経験的データを用いて,選択が低または中間の表現型値を好むとき,遺伝子型-表現型と適応性景観の不一致を系統的に研究した。理論モデルを用いて,多くの基本的結果を証明した。例えば,低または中間の表現型値の選択は,単純サインエピスタシスを逆符号エピスタシスに変化させないが,それは,単純サインエピスタシスに逆符号エピスタシスを変化し,等しい確率でサインエピスタシスをしない。より広くは,そのような選択は,根底にある遺伝子型-表現型景観よりもより頑丈な適応性の景観を生成する傾向があるが,しかし,適応性の景観における局所的適応ピークが,グローバルピークとほぼ高い傾向があるので,この増加した耐久性は,適応進化を典型的にはならないことを示した。これらの結果の多くは,経験的遺伝子型-表現型景観に前進し,なぜ低-および中間-親和性転写因子-DNA相互作用が真核生物遺伝子調節において一般的であるかを説明するのを助けるかもしれない。AUTHOR SUMMARYHowは表現型形質と生物適応度を変化させる。この疑問は,進化理論の古典的メタファ,すなわち適応景観の文脈でしばしば対処される。適応性の景観は,物理的景観に似ており,その中で,遺伝子型は空間座標を定義し,適応性は各座標の上昇を定義する。進化は丘登り過程のように作用し,その集団は突然変異と選択の結果として適応ピークを上昇させる。ハイスループット配列決定技術と表現型アッセイからの実験データを用いて,高分子や遺伝子調節回路などのシステムにおいて,このような景観を構築することはますます一般的になっている。これらの景観は典型的には分子表現型によって定義されるが,遺伝子型-表現型景観としてより適切に参照されるが,それらはしばしば進化動力学を研究するために用いられる。これは,分子表現型が適応度に対する妥当なプロキシであるという仮定を必要とし,それは症例ではない。例えば,選択は,低または中間の表現型値に有利であり,適応景観とその根底にある遺伝子型-表現型景観の間の不一致を引き起こす。ここでは,遺伝子調節系からの理論モデルと実験データの多様性を用いて,そのような不一致を研究した。適応性の景観は,その根底にある遺伝子型-表現型の景観よりも多くのピークを構成する傾向があることを定期的に見出した。しかし,進化シミュレーションを用いて,この増加した耐久性は適応を妨げる必要がないことを示す。【JST・京大機械翻訳】
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, 【Automatic Indexing@JST】
分類 (2件):
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JSTが定めた文献の分類名称とコードです
進化論一般  ,  遺伝子の構造と化学 
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